蛋白质结构与功能课件.pptVIP

由一條肽鏈形成的蛋白質沒有四級結構蛋白質的四級結構含有四級結構的蛋白質，單獨的亞基一般沒有生物學功能，只有完整的四級結構才具有生物學功能第三節蛋白質結構與功能的關係TheRelationofStructureandFunctionofProtein（一）一級結構是構象的基礎一、蛋白質一級結構與功能的關係順序規定構象構象：空間結構、三維結構天然狀態有催化活性非折疊狀態－S－S－被還原無活性天然狀態－S－S－恢復正確配對活性恢復牛RNA酶的變性與複性尿素b-巰基乙醇透析說明蛋白質一級結構是空間結構形成的基礎，而只有具備了特定的空間結構的蛋白質才具有生物學活性C—N單鍵為0.149nmC=N雙鍵為0.127nm因此，肽鍵具有部分雙鍵性質，不能自由旋轉肽鍵中Ｃ－Ｎ鍵長為0.132nm正常情況下：肽單元(peptideunit)：組成肽鍵的4個原子(C、N、O、H)和與之相鄰的2個α碳原子(Cα1、Cα2)位於同一平面，構成所謂的肽單元肽氨基酸借肽鍵相連而形成的化合物稱肽(peptide)MetPhe二肽LysMetPhe三肽CysThrLysMetPhe五肽寡肽：N10多肽：10=N=50蛋白質：N50肽鏈不分支且有方向性CysMetPheLysSerThrValNH2COOH氨基末端(Ｎ-端)羧基末端(C-端)肽鏈中的氨基酸因脫水而基團不全，被稱為氨基酸殘基(residue)讀法：某氨醯某氨醯……某氨酸（二）天然存在的活性肽穀胱甘肽(glutathione，GSH)構成第一個肽鍵的羧基是Glu的γ－羧基由Glu、Cys和Gly組成的三肽GluCysGly(1)組成(2)功能GSH是體內重要的還原劑第二節蛋白質的分子結構TheMolecularStructureofProtein一級結構二級結構三級結構四級結構高級結構或空間結構一、蛋白質的一級結構（primarystructure）

定義：多肽鏈中氨基酸殘基的數目、排列順序及共價連接。主要的化學鍵：肽鍵，有些蛋白質還包括二硫鍵牛胰島素——第一個被測定的一級結構牛胰島素原的一級結構一級結構是蛋白質空間結構和特異生物學功能的基礎，各種蛋白質的根本差異就在於一級結構的不同。二、蛋白質二級結構（secondarystructure）定義：是指蛋白質分子中多肽鏈骨架原子的局部空間排列，不涉及到氨基酸殘基側鏈的構象主要的化學鍵：氫鍵多肽鏈骨架由－N－Ca－C－序列重複排列而成蛋白質二級結構的主要類型α-螺旋(?-helix)β-折疊(?-pleatedsheet)β-轉角(?-turn)無規捲曲(randomcoil)（一）α－螺旋(α-helix)由肽鍵平面盤旋形成的右手螺旋狀構象1.概念最常見、最豐富，呈棒狀2.α-螺旋的結構特徵(1)以肽平面為單位,以α-碳原子為轉折，盤旋形成右手螺旋(生物似乎偏好右手？)左手和右手螺旋NC(2)每3.6個氨基酸殘基繞成一個螺圈(360o),螺距為0.54nm,肽鍵平面與中心軸平行(3)主鏈原子構成螺旋的主體,側鏈在其外部(4)肽鍵的CO和NH都形成氫鍵氫鍵的方向與中心軸大致平行,是穩定螺旋的主要作用力（二）β-折疊(β-pleatedsheet)是由兩條或多條几乎完全伸展的肽段平行排列，通過肽段間的氫鍵交聯而形成的肽段的主鏈呈鋸齒狀折疊構象β-折疊結構特點(1)相鄰肽鍵平面的夾角為1100，呈鋸齒狀排列；側鏈Ｒ基團交錯地分佈在片層平面的兩側。(2)2～5條肽段平行排列構成，肽段之間可順向平行(均從N-C)，也可反向平行。（a）順向平行式（b）反向平行式(3)由氫鍵維持穩定，其方向與折疊的長軸接近垂直（三）β-轉角(?-turn)肽鏈出現180°回折的轉角處的結構（四）無規捲曲(randomcoil)沒有確定規律性的肽鏈構象H2NCOOH（五）超二級結構-----模體（motif）在多肽鏈內順序上相互鄰近的二級結構常常在空間折疊中靠近，彼此相互作用，形成規則的二級結構聚集體三、蛋白質的三級結構（一）定義整條肽鏈中全部氨基酸殘基的相對空間位置，也就是整條肽鏈所有原子