油茶IDD基因家族鉴定与生物信息学分析.pdfVIP

热带作物学报2024,45(2):247258

ChineseJournalofTropicalCrops

油茶IDD基因家族鉴定与生物信息学分析

111123*1,2*

陈健鑫，吴峰婧琳，魏玉倩，杨娅琳，马焕成，杨红玉，伍建榕

1.西南林业大学生物多样性保护学院/云南省高校森林灾害预警控制重点实验室，云南昆明650224；2.西南林业大

学林学院/西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室，云南昆明650224；3.昆明学院农学与生命科学学院，云

南昆明650214

摘要：油茶（Camelliaoleifera）是山茶科（Theaceae）的一种特有的油料植物，具有重要的观赏价值和经济价值，

随着油茶的集约化种植，病虫害大量发生，加之良种选育滞后，严重制约着油茶产业的发展。INDETERMINATE

DOMAIN（IDD）家族是高等植物中一类保守的转录因子，通过介导植物内源激素进而调控植物的基础免疫反应。为

鉴定油茶中IDD基因家族成员，本研究以油茶全基因组信息为参考，通过IDD基因家族保守结构域鉴定了29个油茶

CoIDD基因家族成员，进一步明确了各基因的结构、理化性质、系统进化关系、亚细胞定位。通过RT-PCR克隆到1

个与AtIDD4/5/6同源的CoIDD4基因，明确了其理化性质、表达模式及核定位信号，同时分析了其启动区顺式作用元

件的类型。研究结果表明，29个CoIDD基因家族成员分为4个亚组，平均亲水系数均小于0，属于亲水性蛋白，且亚

细胞定位均位于细胞核内；克隆到CoIDD4基因的全长ORF框包含1620bp碱基，编码539个氨基酸，主要在叶片和

花器官中表达；该基因启动子区顺式作用元件主要是参与光响应和植物激素响应元件两大种类。综上所述，本研究在

油茶中鉴定了29个IDD基因家族成员，其中CoIDD4基因与AtIDD4/5/6亲缘关系较近，推测其可能参与油茶激素信

号转导和基础免疫反应调节等进程，为油茶IDD转录因子功能解析提供理论基础，也为油茶的抗性优良品种选育及分

子育种提供参考依据。

关键词：油茶；IDD基因家族；生物信息学分析；植物激素；抗性调控

中图分类号：S432文献标识码：A

IdentificationandBioinformaticsAnalysisofIDDGeneFamilyin

Camelliaoleifera

111123*

CHENJianxin,WUFengjinglin,WEIYuqian,YANGYalin,MAHuancheng,YANGHongyu,

WUJianrong1,2*

1.CollegeofBiodiversityConservation,SouthwestForestryUniversity/KeyLaboratoryofForestDisasterWarningandControlin

UniversitiesofYunnanProvince,Kunming,Yunnan650224,China;2.CollegeofBiodiversityForestry,SouthwestForestryUniver-

sity/KeyLaboratoryofBiodiversityConservationinSouthwestChina,StateForestryAdministration,Kunming,Yunnan650224,

China;3.CollegeofAgronomyandLifeSciences,KunmingUniversity,Kunming,Yunnan650214,China

Abstract:Ca