3种栗属植物SBP基因家族生物信息学与表达分析.pdfVIP

山东农业科学２０２５ꎬ５７(５):３６~４５ＳｈａｎｄｏｎｇＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅｓ

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ＤＯＩ:１０.１４０８３/ｊ.ｉｓｓｎ.１００１４９４２.２０２５.０５.００４

３种栗属植物ＳＢＰ基因家族生物

信息学与表达分析

１ꎬ２ꎬ３１ꎬ２ꎬ３１ꎬ２ꎬ３２ꎬ３ꎬ４２ꎬ３ꎬ４２ꎬ３ꎬ４

付丽枝ꎬ杨涌ꎬ于克妍ꎬ于立洋ꎬ王旋ꎬ张海娥

(１.河北科技师范学院园艺科技学院ꎬ河北秦皇岛０６６００４ꎻ

２.板栗产业技术教育部工程研究中心ꎬ河北秦皇岛０６６００４ꎻ

３.河北省特色园艺种质挖掘与创新利用重点实验室ꎬ河北秦皇岛０６６００４ꎻ

４.河北省板栗产业协同创新中心ꎬ河北秦皇岛０６６００４)

摘要:ＳＢＰ蛋白是一类广泛参与调节生长发育过程的植物特有转录因子ꎮ本研究从３种栗属植物中鉴定

到５８个ＳＢＰ基因家族成员ꎬ并利用生物信息学方法对其染色体定位、蛋白理化性质、共线性关系等方面进行

了分析ꎮ结果发现ꎬ所有栗属植物ＳＢＰ基因家族成员在染色体上呈非均匀分布ꎬ其中３个ＳＢＰ基因未被组装

到染色体的大片段中ꎮ进化树分析发现栗属植物ＳＢＰ基因家族可以分为７个小组ꎬ小组５中发生了基因的

丢失和扩增ꎮＭｏｔｉｆ分析发现所有ＳＢＰ基因家族成员都包含保守的Ｍｏｔｉｆ１或Ｍｏｔｉｆ２ꎮ共线性基因对的Ｋａ/Ｋｓ

分析发现ꎬＳＢＰ基因家族成员在栗属植物基因组内及组间正在经历纯化选择ꎮ转录组数据分析发现ＣｍＳＢＰ

基因家族在不同时期中国板栗芽与果实中的表达量变化明显ꎮ本研究结果可为后续栗属植物ＳＢＰ基因功能

研究提供理论基础ꎮ

关键词:栗属植物ꎻＳＢＰ基因家族ꎻ选择压力ꎻ生物信息学分析ꎻ表达分析

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中图分类号:Ｓ６６４.２文献标识号:Ａ文章编号:１００１４９４２(２０２５)０５００３６１０

ＢｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓａｎｄＥｘｐｒｅｓｓｉｏｎＡｎａｌｙｓｉｓｏｆＳＢＰＧｅｎｅＦａｍｉｌｙ

ｉｎＴｈｒｅｅＣａｓｔａｎｅａＰｌａｎｔｓ

１ꎬ２ꎬ３１ꎬ２ꎬ３１ꎬ２ꎬ３２ꎬ３ꎬ４２ꎬ３ꎬ４２ꎬ３ꎬ４

ＦｕＬｉｚｈｉꎬＹａｎｇＹｏｎｇꎬＹｕＫｅｙａｎꎬＹｕＬｉｙａｎｇꎬＷａｎｇＸｕａｎꎬＺｈａｎｇＨａｉ’ｅ

(１.ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＨｏｒｔｉｃｕｌｔｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅａｎｄＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙꎬＨｅｂｅｉＮｏｒｍａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆＳｃｉｅｎｃｅａｎｄＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙꎬＱｉｎｈｕａｎｇｄａｏ０６６００４ꎬＣｈｉｎａꎻ

２.ＥｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇＲｅｓｅａｒｃｈＣｅｎｔｅｒｏｆＭｉｎｉｓｔｒｙｏｆＥｄｕｃａｔｉｏｎｆｏｒＣｈｅｓｔｎｕｔＩｎｄｕｓｔｒｕａｌＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙꎬＱｉｎｈｕａｎｇｄａｏ０６６００４ꎬＣｈｉｎａꎻ

３.ＫｅｙＬａｂｏｒａｔｏｒｙｏｆＧｅｒｍｐｌａｓｍＭｉｎｉｎｇａｎｄＩｎｎｏｖａｔｉｖｅＵｔｉｌｉｚａｔｉｏｎｏｆＨｅｂｅｉＰｒｏｖｉｎｃｅꎬＱｉｎｈｕａｎｇｄａｏ０６６００４ꎬＣｈｉｎａꎻ

４.ＨｅｂｅｉＰｒｏｖｉｎｃｅＣｈｅｓｔｎｕｔＩｎｄｕｓｔｒｙＣｏｌｌａｂｏｒａｔｉｖｅＩｎｎｏｖａｔｉｏｎＣｅｎｔｅｒꎬＱｉｎｈｕａ