hsa-miR-181a-5p靶基因预测及生物信息学分析.pdfVIP

第47卷第2期遵义医科大学学报Vol.47No.2

2024年2月JournalofZunyiMedicalUniversityFeb.2024

基础研究

hsa-miR-181a-5p靶基因预测及生物信息学分析

王艳阳1.2,刘婵12,周

雪”，张隆泽”，余丽梅12，何志旭1.2.4

（1.遵义医科大学附属医院贵州省细胞工程重点实验室，贵州遵义563099;2.遵义医科大学组织损伤修复与再生医学省

部共建协同创新中心，贵州遵义563099;3.遵义医科大学基础医学院免疫学教研室，贵州遵义563099;4.贵州省儿童

医院，遵义医科大学附属医院小儿内科，贵州遵义563099）

【摘要】目的对hsa-miR-181a-5p进行系统的生物信息学分析,预测hsa-miR-181a-5p的靶基因、基因功能及信号通路,并

对其进行生物学功能注释。方法利用数据库对hsa-miR-181a-5p基因定位,分析其序列保守性和在人类组织器官中的表达

情况；利用数据库进行靶基因预测分析；并将预测交集靶基因进行GO功能分析及KEGG通路富集分析和蛋白间相互作用

(PPI)网络分析；最后利用A549细胞进行hsa-miR-181a-5p转染实验，进行转录组测序同步验证生物信息学预测结果。

结果发现基因定位于人类基因组chrl、chr9染色体，成熟序列在物种间具有高度保守性。3个数据库交集靶基因有483

个，包含PTEN、MAPK8、AKT3等基因,其分布在胞浆等细胞组分，执行蛋白质结合等生物功能,并参与信号转导等生物学过

程。靶基因富集于MAPK、PI3K-Akt、胰岛素抵抗、癌症中的miRNA等信号通路,其编码的蛋白间形成复杂网络图。实验后

转录组测序结果验证了生信分析的准确性,对预测及富集结果提供了有力支撑。结论hsa-miR-181a-5p在多种生物学过程

发挥重要作用，尤其是在神经系统疾病、血液免疫系统疾病以及癌症的发生发展中其将成为相关疾病发生机制和防治研究

的新靶点。

【关键词】hsa-miR-181a-5p；生物信息学分析；信号通路；蛋白质相互作用

[中图法分类号]Q811.4[文献标志码］A[文章编号】2096-8159(2024)02-0107-14

Targetgenepredictionandbioinformaticsanalysisforhsa-miR-181a-5p

WangYanyang2,LiuChan2,ZhouXue,ZhangLongze,YuLimeil,He

1/1,2,4

Zhixu

(1.DepartmentofCellEngineeringLaboratory,AffiliatedHospitalofZunyiMedicalUniversity,ZunyiGuizhou

563099,China;2.TheMinistryofTissueDamageRepairandRegenerativeMedicineJointlyEstablishedaCol-

laborativeInnovationCenter,ZunyiGuizhou563099,China;3.DepartmentofImmunology,SchoolofPreclini-

calMedicine,ZunyiMedicalUniversity,ZunyiGuizhou563099,China;4.DepartmentofPediatrics,Guizhou

ChildrensHospital,AffiliatedHospitalofZunyiMedicalUniversity,ZunyiGuizhou563099,China)

[Abstract]ObjectiveTosystematicallyanalyzethebioinformaticsofhsa-miR-181a-5p,pred