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分子植物育种,2024年,第22卷,第17期,第5610-5621页
MolecularPlantBreeding17,5610-5621
研究报告
ResearchReport
十字花科植物抗氧化基因(OXR)的鉴定与生物信息学分析
侯喜林4刘同坤4单国雷1陈汪
张梦云1侯金锋1.23唐小燕12.3
朱世东1.2.3陈国户1,2.3
袁凌云12.3
承刚1.2.3*
1安徽农业大学园艺学院,蔬菜遗传育种实验室,合肥,230036;2安徽省园艺作物育种工程实验室,合肥,230036;3皖江蔬菜工业技术研究院,
马鞍山,238200;4南京农业大学园艺学院,南京,210095
*通信作者,cgwang@
摘要OXR(Oxidationresistance)基因含有TLDc保守结构域,能够有效清除活性氧,在细胞抗氧化损伤
中起着重要的作用。本研究基于小盐芥(Thellungiellahalophila,Tha)、白菜(Brassicarapa,Bra)、甘蓝(Brassica
oleracea,Bol)、黑芥(Brassicanigra,Bni)、甘蓝型油菜(Brassicanapus,Bna)、芥菜型油菜(Brassicajuncea,Bju)和
胡萝卜(Daucuscarota,Dca)7种十字花科植物基因组数据库,通过与拟南芥(Arabidopsisthaliana,At)的6个
OXR基因序列比对,共筛选鉴定出所选植物的50个OXR基因家族成员,并对其进行生物信息学分析。系统
进化树的构建表明,OXR基因家族成员有5个亚分支;顺式作用元件分析显示,OXR基因启动子区域含有
多个响应温度和激素的顺式作用元件和结合位点,表明十字花科植物的OXR基因家族成员可能参与逆境
响应和激素调节;OXR基因在染色体上分布不均匀,并有24对OXR串联重复基因,表明OXR基因具有高
度保守性。本研究为进一步揭示植物OXR基因的功能提供了依据。
关键词十字花科;OXR基因家族;生物信息学分析
IdentificationandBioinformaticsAnalysisofAntioxidantGenes(OXR)in
CruciferousPlants
1,2,31,2,3Shan
ZhangMengyun1YuanLingyun1.2.3ZhuShidongHouJinfengHouXilin4LiuTongkun4
ChenGuohu1,2.31,2.3*
Guolei!(TangXiaoyan1.2.3WangChenggang
1VegetableGeneticsandBreedingLaboratory,CollegeofHorticulture,AnhuiAgriculturalUniversity,Hefei,230036;2ProvincialEngineeringLabo-
ratoryforHorticulturalCropBreedingofAnhui,Hefei,230036;3WanjiangVegetableIndustrialTechnologyInstitute,Maanshan,238200;4Collegeof
Horticulture,NanjingAgriculturalUniversity,Nanjing,210095
*Corresauth@
DOI:10.13271/j.mpb.022.005610
Abstr
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初级会计持证人
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