芥菜Trihelix转录因子家族全基因组鉴定分析.pdfVIP

分子植物育种，2025年，第23卷，第3期，第733-747页

MolecularPlantBreeding2025,Vol.23,No.3,733-747

研究报告

ResearchReport

芥菜Trihelix转录因子家族全基因组鉴定分析

李魁印122胡云1李伟付文苑3杨巍3

段丽丽唐兵3常向彩1

1安顺学院农学院，安顺，561000；2贵州大学农学院，贵阳，550025；3贵州省农业科学院园艺所，贵阳，550006

*通信作者，Changxiangcai31@126.com

摘要Trihelix转录因子在调控植物的生长发育、生理代谢和响应逆境胁迫等方面起重要作用。为了研究

芥菜Trihelix基因家族的生物学功能和参与调控茎膨大的机理，从芸墓属基因组数据库下载芥菜基因组数

据，结合从转录组数据，对芥菜Trihelix转录因子家族成员进行鉴定，运用生物信息学方法在芥菜全基因组

数据库中鉴定出81个Trihelix家族成员。利用生物信息软件对芥菜的Trihelix家族成员进行全面分析，包括

理化性质分析、染色体定位、亚细胞定位、系统发育关系、共线性分析、基因结构及保守基序分析、茎膨大时期

的特异性分析。根据亲缘关系分为4个亚家族，并且基因结构分析、保守基序分析与聚类分析具有一致性。表

达模式分析显示Trihelix家族基因可能在芥菜茎膨大中起重要作用。在鉴定出的81个芥菜Trihelix家族基

因成员中，SIP1亚组成员在芥菜茎发育时期特异性表达，推测在芥菜茎的生长发育过程中起重要作用，其中

BjuA010701、BjuB046251、BjuB046548、BjuB042327、BjuB023618、BjuA017962在茎瘤芥茎的不同发育阶段表

达量较高，可为芥菜的发育研究提供候选基因。该研究同时也为其他植物中Trihelix家族的鉴定提供了基

础，为进一步明确芥菜Trihelix家族转录因子的生物学功能提供依据。

关键词芥菜(Brassicajuncea);Trihelix家族；全基因组鉴定;生物信息分析；表达分析

AnalysisofGenomeIdentificationofTrihelixTranscriptionFactorFamily

inBrassicajuncea

DuanLili2HuYun1LiWei23YangWei3

LiKuiyinI.2FuWenyuan3TangBing3ChangXiangcai*

1CollegeofAgriculture,AnshunUniversity,Anshun,561000;2CollegeofAgriculture,GuizhouUniversity,Guiyang,550025;3InstituteofHorticul-

ture,GuizhouAcademyofAgriculturalSciences,Guiyang,550006

*Correspondingauthor,Changxiangcai31@126.com

DOI:10.13271/j.mpb.023.000733

DOI:10.13271/j.mpb.023.000733

AbstractTrihelixtranscriptionfactorsplayanimportantroleofregulationtoplantphysiologicalmetabolism,

growthanddevelopment,andresponsetoadversitystress.Inordertostudythebiologicalfunctionandstem

expansionmechanismoftheBrassicajunceabyTrihelixgenefamilyregulation,thegenomedataofB.junceawas

downloadedfromtheBrassicagenomedatabase,combinedwiththetranscriptomedata,themembersofthe

T