牡丹PomiR2592bj及其靶基因PoSDR1的克隆与生物信息学分析.pdfVIP

河南农业科学，2025，54（3）：120‑128

JournalofHenanAgriculturalSciencesdoi:10.15933/ki.1004-3268.2025.03.013

牡丹PomiR2592bj及其靶基因PoSDR1的克隆与

生物信息学分析

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雷炀，高靖姗，南琼琼，郭丽丽，侯小改

（1.河南科技大学农学院，河南洛阳471023；2.洛阳农发投资集团有限公司，河南洛阳471023）

摘要：基于前期对牡丹早花品种凤丹、凤丹早花突变植株和晚花品种连鹤转录组、miRNA和降解组联

合分析，挖掘到调控牡丹花期的PomiR2592bj及其靶基因PoSDR1。为探究牡丹PomiR2592bj和PoSDR1

的生物学特性及功能，克隆得到了113bp的PomiR2592bj和1380bp的PoSDR1序列，二级结构分析表

明，PomiR2592bj的前体序列可形成稳定的茎环结构，成熟序列分布在其3臂端；多序列比对表明，

PomiR2592bj成熟序列具有保守性；系统进化树分析显示，miR2592家族分为了10个分支，且具有同源

性。PoSDR1基因编码的蛋白质含296个氨基酸，具有亲水性，不存在跨膜结构域，不存在信号肽，Ser位

点有19个被磷酸化，Thr位点有11个被磷酸化，Tyr位点有2个被磷酸化，具有NADB_Rossmann超家族

保守域。PomiR2592bj经预测与PoSDR1具有靶向关系。

关键词：牡丹；PomiR2592bj；PoSDR1；克隆；生物信息学

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中图分类号：S682.19文献标志码：A文章编号：1004-3268（2025）03-0120-09

CloningandBioinformaticsAnalysisofPomiR2592bjandItsTarget

GenePoSDR1ofTreePeony

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LEIYang，GAOJingshan，NANQiongqiong，GUOLili，HOUXiaogai

（1.CollegeofAgriculture，HenanUniversityofScienceandTechnology，Luoyang471023，China；

2.LuoyangAgriculturalDevelopmentInvestmentGroupCo.，Ltd.，Luoyang471023，China）

Abstract：：Basedonthepreviousanalysisoftransciptome，miRNAanddegradomeofearly‑flowering

Fengdan，early‑floweringFengdanmutantplants，andlate‑floweringLianhe，weidentifiedPomiR2592bj

anditstargetgenePoSDR1，whichwereexcavatedtoregulatethefloweringperiodoftreepeony.To

furtherelucidatethebiologicalcharacteristicsandfunctionsofPomiR2592bjandPoSDR1，wecloneda

113bpsequenceforPomiR2592bjanda1380bpsequenceforPoSDR1.Secondarystructureanalysis

revealedthattheprecursorsequenceofPomi