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分子植物育种,2024年,第22卷,第10期,第3172-3187页
MolecularPlantBreNo.10,3172-3187
研究报告
ResearchReport
白桦SAUR基因家族鉴定及生物信息学分析
刘超逸1*王宇航2
1赤峰学院化学与生命科学学院,赤峰,024000;2内蒙古赤峰市林业科学研究所,赤峰,024000
*通信作者163.com
摘要SAUR基因家族作为植物生长素早期响应基因家族中最大的一个家族,参与到植物细胞伸长、果实发
育、胁迫应答等多个生物学过程。本研究基于白桦全基因组数据,对白桦SAUR基因家族进行鉴定和生物信息学
分析。结果表明,白桦共有61个SAUR家族基因,这些基因不均匀分布在14条染色体上,理化性质分析表明,大
部分BpSAUR蛋白呈碱性,为不稳定蛋白,脂溶性系数较高,为亲水性;系统进化和基因结构分析表明,61个白
桦SAUR基因被分为4类(GroupI~GroupIV),其中GroupIV中BpSAUR基因最多,同一分类的BpSAUR基因
更倾向于在染色体上聚集分布,大部分白桦SAUR家族基因为无内含子或少内含子基因。白桦SAUR家族基因
启动子还拥有多个光响应、激素响应元件与逆境胁迫作用元件,说明其可能参与白桦生长发育及胁迫应答等多
个生物学过程。该家族基因在白桦的不同组织部位和不同发育阶段的表达量也不同,主要在幼茎、成熟茎和成熟
叶中集中表达。本研究通过对白桦SAUR基因家族进行深入分析,以期为白桦分子育种奠定良好基础。
关键词白桦;SAUR(Smallauxin-upRNA);全基因组;生物信息学分析
IdentificationandBioinformaticsAnalysisofSAURGeneFamilyinBetula
platyphylla
LiuChaoyiI*WangYuhang
1CollegeofLifeScience,ChifengUniversity,Chifeng,024000;2ChifengAcademyofForestryScience,Chifeng,024000
*Correspondilauthor163.com
DOI:10.13271/j.mpb.022.003172
AbstractSAURgenefamily,asthelargestfamilyofplantauxinearlyresponsegenefamily,isinvolvedinmany
biologicalprocessessuchasplantcellelongation,fruitdevelopment,stressresponseandsoon.Basedonthe
wholegenomedataofBetulaplatyphylla,thisstudyidentifiedandbioinformaticsanalyzedtheSAURgenefamily
ofBetulaplatyphylla.Theresultsshowedthattherewereatotalof61SAURfamilygenesinBetulaplatyphylla,
whichwereunevenlydistributedon14chromosomes.PhysicalandchemicalanalysisshowedthatmostoftheBp-
SAURproteinswerealkalineandunstable,withahighlipophiliccoefficientandhydrophilicity;systemicevolu-
tionandgenestructureanalysisindicatethat61SAURgenesinBetulaplatyphyllaareclassifiedinto4categories
(GroupItoGroupIV),withthehighestBpSAURgeneinGroupIV.BpSAURgenesinthesamecategorytendto
aggregateanddistribute
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