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分子植物育种,2024年,第22卷,第21期,第6961-6972页
MolecularPlantBr1,6961-6972
研究报告
ResearchReport
红花DBB基因家族全基因组鉴定及生物信息学分析
1,2
赵乐12朱哟昊12王敏3草马利刚
韩永光1冯卫生12郑晓珂12时博*
1河南中医药大学药学院,郑州,4500462河南中医药大学,呼吸疾病中医药防治省部共建协同创新中心,郑州,450046;3北京工商大学化学
与材料工程学院,北京,100048
*通信作者,xiaosehanfeng@126.com
摘要DBB(DoubleB-box)转录因子在植物生长发育过程中起着重要作用,本研究利用生物信息学方法
对红花DBB基因家族进行了全基因组鉴定和分析。研究表明,红花DBB基因家族有5个亚家族共26个成
员。序列分析显示,红花DBB蛋白N端含有一个或两个B-box结构域,在C端偶尔包含一个CCT结构域。
理化性质分析表明,红花DBB基因家族成员编码蛋白质的氨基酸数目为197~789、理论等电点为
4.12~7.68、相对分子量为21.96~87.82kD,大多数成员都位于细胞核。染色体定位表明,26个红花DBB基因
家族成员不均匀地分布在红花的12条染色体上。对红花DBB基因上游1500bp启动子区域顺式作用元件
分析表明,绝大多数基因受到光的调控,部分基因受到生长素、赤霉素、脱落酸等植物激素的调控。蛋白互作
网络分析显示,红花DBB基因家族成员可能参与光形态建成、开花和光周期等生长发育过程。本研究为今
后深入研究红花DBB基因的功能和调控机制提供基础,也为寻找红花中的光响应基因提供了参考。
关键词红花;DBB基因家族;生物信息学分析;生长发育
Genome-wideIdentificationandBioinformaticsAnalysisofDBBGene
FamilyinCarthamustinctorius
ZhaoLe12ZhuYunhao12WangMin3HanYongguang!MaLigangl2FengWeishengl2ZhengXiaokeI,2
ShiBo1*
1CollegeofPharmacy,HenanUniversityofChineseMedicine,Zhengzhou,450046;2CollaborativeInnovationCenterforChineseMedicineandRes-
piratoryDiseasesCo-constructedbyHenanProvinceEducationMinistryofP.R.China,HenanUniversityofChineseMedicine,Zhengzhou,450046;
3CollegeofChemistryandMaterialsEngineering,BeijingTechnologyandBusinessUniversity,Beijing,100048
*Correspondinuthooseha
anfeng@126.com
DOI:10.13271/j.mpb.022.006961
AbstractDBB(DoubleB-box)transcriptionfactorsplayanimportantroleinthegrowthanddevelopmentof
plants.Inthisstudy,thebioinformaticsmethodswereusedtoconductgenome-wideidentificationandanalysisof
thesafflower(Carthamustinctorius)DBBgenefamily.ThestudyshowedthattheDBBgenefamilyofsafflower
has5subfamilieswith26members.Thesequenceanalysiss
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