广东紫珠叶绿体基因组特征分析.pdfVIP

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李家敏等广东紫珠叶绿体基因组特征分析种子第卷第期

445

广东紫珠叶绿体基因组特征分析

12311

李家敏,李晓花,周家春,张兵锋,李馨悦

(,;、,;

宜春学院江西宜春江西省中国科学院庐山植物园江西九江

1.3360002.332900

,)

黔南州林业资源调查监测中心贵州都匀

3.558000

:,,。

摘要以广东紫珠为材料利用高通量测序技术测序其叶绿体基因组序列组装并注释获得完整的叶绿体基因组结

,(),:(,

果表明广东紫珠叶绿体基因组GenBankNo.OR540410大小为154185bp具有四分体结构一个大单拷贝区LSC

)、(,)(、,),;

84958bp一个小单拷贝区SSC17825bp和一对反向重复序列IRaIRb均为25701bp总GC含量为38.08%叶

,,,;

绿体基因组共编码了个基因其中蛋白质编码基因个基因个基因个同义密码子使用度

13186tRNA37rRNA8

(),/;,()

大于的密码子个侧重于使用结尾的密码子共鉴定出散在重复序列个简单重复序列

RSCU130AT62SSR58

,/;,、、、、、、;

个以重复为主选择压力分析表明共个基因出现正选择信号系统

ATc2sbDrbcLsbBetBrs8ndhF7

yfpppp

,。

发育分析表明广东紫珠与华紫珠的亲缘关系最密切

:;;;

关键词广东紫珠叶绿体基因组密码子偏好性系统发育分析

:/

DOI1

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