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天津中医药年月第卷第期
20255425
638TianjinJournalofTraditionalChineseMedicineMay2025,Vol.42No.5
:
DOI10.11656/j.issn.1672-1519.2025.05.15
大花水蓑衣叶绿体基因组特征及系统发育分析
张婷婷,张悦,邢志美,李慧,田晓轩
(天津中医药大学,天津301617)
摘要:[目的]对大花水蓑衣及其同属近源物种Hygrophilasp.叶绿体基因组进行测序和分析,解析叶绿体基因组
结构特征、探究系统发育位置和进化关系。[方法]对大花水蓑衣及其同属近源物种Hygrophilasp.的叶绿体基因组进
行测序,借助生物分析学方法及工具进行组装、注释和特征分析,并构建最大似然树进行系统发育分析。[结果]Hy-
grophilamegalanthaMerr.和Hygrophilasp.的叶绿体基因组序列长度分别为146373bp和146698bp,大单拷贝区
LSC90414bp90572bpSSC17677bp17720bpIR
()长度分别为和,小单拷贝区()长度分别为和,反向重复区()长
19141bp19203bp1308636tRNA8rRNA
度分别为和;均编码个基因,包括个蛋白编码基因、个基因和个基因;
Hygrophilamegalantha和Hygrophilasp.分别有24580和24645个密码子,均倾向使用以碱基A/U结尾的密码子;微
SSRs5746SSRsA/THygrophilamegalanthaHygrophilasp.
卫星序列()分析分别检测出、个,以碱基重复较多;以和在
173
内的个芦莉草族的叶绿体基因组为内群,另选取个爵床亚科下芦莉草族外的叶绿体基因组作为外类群,构建系
统发育树,结果显示Hygrophilamegalantha和Hygrophilasp.聚为一支,亲缘关系较近。[结论]首次报道了大花水蓑衣
的叶绿体基因组,对其序列变异及结构特征进行了深入解析,并基于叶绿体基因组构建了系统发育树,为以其种子入
药的药材广天仙子的基原鉴定、资源开发利用提供了重要的研究基础。
关键词:大花水蓑衣;广天仙子;叶绿体基因组;系统发育分析
中图分类号:R282文献标志码:A
文章编号:1672-1519(2025)05-0638-09
大花水蓑衣(HygrophilamegalanthaMerr.)是爵组进行组装和分析,旨在分析系统发育位置和进化
床科水蓑衣属的植物,其种子可作药用,称“广天仙关系提供研究依据。
[1]
子”,收载于《儿茶等43种进口药材质量标准》。具
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