第10章微生物的分类鉴定.ppt

在疑难菌株鉴定、新种命名、建立一个新的分类单位时，G+C含量是一项重要的，必不可少的鉴定指标。其分类学意义主要是作为建立新分类单元的一项基本特征和把那些G+C含量差别大的种类排除出某一分类单元。G+C含量的比较主要用于分类鉴定中的否定第30页，共56页，星期日，2025年，2月5日2、核酸的分子杂交不同生物DNA碱基排列顺序的异同直接反映生物之间亲缘关系的远近，碱基排列顺序差异越小，它们之间的亲缘关系就越近，反之亦然。直接分析比较DNA的碱基排列顺序------由于技术上的困难目前尚难以普遍地进行；核酸分子杂交(hybridization)间接比较不同微生物DNA碱基排列顺序的相似性第31页，共56页，星期日，2025年，2月5日1）DNA-DNA杂交；（亲缘关系相对近的微生物之间的亲缘关系比较）2）DNA-rRNA杂交；（亲缘关系相对远的微生物之间的亲缘关系比较）3）核酸探针；（利用特异性的探针，用于细菌等的快速鉴定）第32页，共56页，星期日，2025年，2月5日第33页，共56页，星期日，2025年，2月5日第34页，共56页，星期日，2025年，2月5日特异性的探针主要用于病原微生物的快速鉴定第35页，共56页，星期日，2025年，2月5日3、电子杂交随着微生物基因信息，特别是全基因组完全测序的不断增加，我们可以通过各种计算机软件对不同物种的遗传信息进行直接比较，从而分析不同微生物间的亲缘关系。第36页，共56页，星期日，2025年，2月5日蛋白质、RNA和DNA序列进化变化的显著特点是进化速率相对恒定，也就是说，分子序列进化的改变量(氨基酸或核苷酸替换数或替换百分率)与分子进化的时间成正比。4、16SrRNA编目分析a）在两群生物中，如果同一种分子的序列差异很大时，------------进化距离远，进化过程中很早就分支了。b）如果两群生物同一来源的大分子的序列基本相同，------------处在同一进化水平上。第37页，共56页，星期日，2025年，2月5日16SrRNA被普遍公认为是一把好的谱系分析的“分子尺”：1）rRNA具有重要且恒定的生理功能；2）在16SrRNA分子中，有高度保守、中度保守和高度变化序列区域，因而它适用于进化距离不同的各类生物亲缘关系的研究；3）16SrRNA分子量大小适中，便于序列分析；4）rRNA在细胞中含量大(约占细胞中RNA的90%)，也易于提取；5）16SrRNA普遍存在于真核生物(同源分子是18SrRNA)和原核生物中。因此它可以作为测量各类生物进化的工具。4、16SrRNA编目分析第38页，共56页，星期日，2025年，2月5日核糖体RNA第39页，共56页，星期日，2025年，2月5日第40页，共56页，星期日，2025年，2月5日第1页，共56页，星期日，2025年，2月5日地球上开始出现生命，主要是些类似简单杆状细菌的原始生物。大约46亿年前，地球形成；大约35亿年前，通过“前生命的化学进化”过程漫长的进化历程千姿百态的生物种类第2页，共56页，星期日，2025年，2月5日形成于35亿年前的微生物化石主要是些类似简单杆状细菌的原始生物形成于8.5亿年前的微生物化石20亿年前以后的岩石中的微生物的化石形态多样性明显增多第3页，共56页，星期日，2025年，2月5日形成于10亿年前的微生物化石形态上非常类似于现代的蓝细菌，进行不产氧光合作用的光能自养菌，及化能无机营养的硫细菌。形态上类似于现代的绿藻（真核生物）第4页，共56页，星期日，2025年，2月5日第5页，共56页，星期日，2025年，2月5日微生物分类学的基本任务：对已知的大量的提炼出分类单元1、分类2、鉴定3、命名给新发现物种命名（一般用拉丁语）对未知的个别的进行鉴定，归入分类系统第6页，共56页，星期日，2025年，2月5日一分类单元界（Kingdom）门（Phylum或Division）纲（Class）目（Order）科（Family）属（Genus）种（Species）第一节通用分类单元第7页，共56页，星期日，2025年，2月5日二种的概念动物的种：凡两个能互相交配产生具有有性生殖能力的物种。微生物的种：是最基本的分类单元，它是表型特征高度相似，亲缘关系极其相近，与同属内的其它种有着明显差异的菌株的总称。菌株（Strain）：任何由一个独立分离的单细胞繁殖而成的纯种的种群（纯培养物）及其一切后代。模式菌株（种）：是被指定的代表一个种的菌株，该菌株具有此种