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不同地理种群长吻鮠遗传多样性的SSR标记分子生态研究

目录

一、文档概要．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.1.1长吻鲠的生物学特性概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

1.1.2遗传多样性研究的重要性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

1.1.3SSR标记在遗传多样性研究中的应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

1.2国内外研究现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

1.2.1长吻鲠遗传标记研究进展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

1.2.2SSR标记在鱼类遗传多样性研究中的应用．．．．．．．．．．．．．．．．．15

1.2.3分子生态学研究方法进展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

1.3研究目标与内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19

1.3.1研究目标．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21

1.3.2研究内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

二、材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

2.1实验材料．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27

2.1.1不同地理种群长吻鲠样本采集．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

2.1.2样本保存与DNA提取．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30

2.2实验方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

2.2.1SSR引物筛选与特异性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

2.2.2SSR扩增条件优化．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39

2.2.3SSR数据采集与．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40

2.2.4数据统计分析方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43

三、结果与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．48

3.1不同地理种群长吻鲠SSR扩增结果．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．51

3.1.1引物扩增产物分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．54

3.1.2优化的SSR标记体系建立．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．56

3.2不同地理种群长吻鲠遗传多样性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．58

3.2.1各地理种群遗传多样性指数计算．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．59

3.2.2不同地理种群间遗传分化分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．61

3.2.3遗传距离与地理距离关系分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．62

3.3不同地理种群长吻鲠遗传结构分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．64

3.3.1遗传结构分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．66

3.3.2主成分分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．67

3.4不同地理种群长吻鲠分子变异分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．68

四、讨论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．71

4.1不同地理种群长吻鲠遗传多样性特征．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．72

4.1.1研究结果与已有研究的比较．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．75

4.1.2影响长吻鲠遗传多样性的因素分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．77

4.2不同地理种群长吻鲠遗传分化机制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．78

4.2.1地理隔离对遗传分化的影响．．．