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第41卷第4期中南林业科技大学学报Vol.41No.4
2021年4月JournalofCentralSouthUniversityofForestryTechnologyApr.2021
Doi:10.14067/ki.1673-923x.2021.04.015http://
常绿木质藤本植物黑老虎基因组SSR特征分析
及引物开发
邹建文,罗先权,饶红欣,李小飞,颜立红,何润华,陈灵
(湖南省森林植物园,湖南长沙410116)
摘要:【目的】开发黑老虎SSR标记,为其群体遗传学研究以及种质资源收集、保存、评价以及良种选育提
供依据。【方法】基于高通量测序获取候选SSR位点,设计引物进行PCR扩增及其产物多态性检测;以湖南会
同、城步和桂东3个天然群体66个黑老虎植株为供试材料,选取多态位点开展遗传多样性分析,并应用5个近
缘种25个植株探讨SSR标记的通用性。【结果】通过高通量测序检索到152207个候选SSR位点,以二核苷酸
重复比例(57.69%)最大,其次为单核苷酸(17.30%)和四核苷酸重复(10.68%);单、二、三、四、五和六
核苷酸重复单元分别以A/T(98.06%)、AC/GT(57.30%)、AAG/CTT(41.91%)、AAAT/ATTT(29.55%)、
AAAAT/ATTTT(29.18%)和ACACAT/ATGTGT(40.31%)最为普遍。从160对SSR引物中筛选出28对,能
成功进行PCR扩增且获得多态位点;3个天然群体的遗传多样性分析结果表明,28个位点共有168个等位基因,
每位点等位基因数为2~14,实际杂合度和期望杂合度分别为0.000~0.900和0.000~0.860;会同、城步和
P
桂东群体分别有9、13和7个位点显著偏离Hardy-Weinberg平衡(<0.05),未发现位点间连锁不平衡现象
P
(≥0.05)。28个位点中,有24和14个可应用于南五味子和异形南五味子,而对于翼梗五味子、华中五味
子和狭叶五味子,则通用性偏低,仅6~9个位点得以成功扩增。【结论】开发出的28个SSR标记,可应用于
黑老虎及其近缘种的遗传多样性分析、种质资源评价、种质鉴定以及分子标记辅助育种等。
关键词:黑老虎;SSR标记;种间通用性;高通量测序;遗传多样性
中图分类号:S718.3文献标志码:A文章编号:1673-923X(2021)04-0130-09
CharactersofgenomicSSRsanddevelopmentof28SSRmarkersfor
Kadsuracoccinea,anevergreenwoodyvine
ZOUJianwen,LUOXianquan,RAOHongxin,LIXiaofei,YANLihong,HERunhua,CHENLing
(HunanForestBotanicalGarden,Changsha410116,Hunan,China)
Abstract:Objectiv
初级会计持证人
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