克氏原螯虾Hox基因家族鉴定、进化与表达分析.pdfVIP

第46卷第4期渔业科学进展Vol.46,No.4

2025年8月PROGRESSINFISHERYSCIENCESAug.,2025

DOI:10.19663/j.issn2095-9869.20240829001/

魏啸宇,胡倩,顾泽茂,李艳和.克氏原螯虾Hox基因家族鉴定、进化与表达分析.渔业科学进展,2025,46(4):168–182

WEIXY,HUQ,GUZM,LIYH.Identification,evolutionandexpressionanalysesoftheHoxfamilyinProcambarusclarkii.

ProgressinFisherySciences,2025,46(4):168–182

克氏原螯虾Hox基因家族鉴定、进化与表达分析*

1111,2①

魏啸宇胡倩顾泽茂李艳和

(1.华中农业大学水产学院湖北武汉430070；2.农业农村部淡水生物繁育重点实验室

长江经济带大宗水生生物产业绿色发展教育部工程研究中心湖北武汉430070)

摘要Hox基因家族是一类与真核生物形态发育密切相关的重要基因。为解析克氏原螯虾

(Procambarusclarkii)Hox基因的表达模式以及参与形态发育调控的功能和机制，本研究基于克氏原

螯虾基因组和转录组数据，结合生物信息学的方法对Hox基因家族进行鉴定，并对其序列结构、

蛋白理化性质、亚细胞定位预测、物种间共线性情况、系统发育、选择压力、早期发育表达模式和

组织分布特征进行了初步分析。结果显示，在克氏原螯虾中鉴定出同一染色体上成簇排列的8个

Hox基因(lab、pb、Dfd、Scr、Antp、Ubx、abd-A和Abd-B)，除Abd-B基因外，其他基因编码的

Hox蛋白均具有一个含YPWM的motif和一个高度保守的Homeodomain结构域；克氏原螯虾Hox

蛋白均为亲水性蛋白和不稳定蛋白；亚细胞定位预测显示，克氏原螯虾Hox蛋白主要定位于细胞

核；Hox基因家族的不同成员在虾蟹类物种中具有不同的系统发育历史；克氏原螯虾Hox基因主要

经历了纯化选择，且不同的Hox基因在甲壳类物种间存在不同的进化速率；Hox基因家族不同成员

在克氏原螯虾早期发育不同时期和成虾不同组织的相对表达量有所差异，且在不同组织的相对表达

量雌虾普遍高于雄虾。研究结果丰富了甲壳类动物Hox基因的研究，为克氏原螯虾形态发育和进

化研究提供了基础资料。

关键词克氏原螯虾；Hox基因；基因鉴定；表达分析

中图分类号S917文献标识码A文章编号2095-9869(2025)04-0168-15

同源异型盒(homeoboxgenes)基因在真核生物基不同的辅因子相互作用来调节其对基因组中特定位

因组中普遍存在且都可转录出约60个氨基酸的同源点的结合偏好，使每个Hox基因特异性地调控下游靶

异型结构域(孙晓晴,2015)。Hox基因是目前研究最多基因的表达，从而决定特定器官、部位的形成和功能

的一类同源异型盒基因，它们通常在染色体上呈簇状(Pintoetal,2024;邱琪琪,2022)。

分布，在生物的胚胎发育、细胞分化、躯体模式的决