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花生微卫星DNA：分离技术、多态性特征与应用前景探究

一、引言

1.1研究背景与意义

花生（ArachishypogaeaL.），又名落花生或长生果，属豆科落花生属植物，是全球广泛种植的重要经济作物和油料作物。花生的种植历史源远流长，原产于南美洲巴西，如今已在世界各地广泛栽培，我国约于十六世纪引入花生种植，目前花生在我国的种植范围极为广泛，除西藏、青海、香港外，各地均有种植。山东、河南、河北、苏皖两省北部等地区都是花生的主要产区，其中河南和山东是我国最大的两个花生种植省份，种植面积占比分别达26.04%和15.05%。从地理区域划分，我国花生种植区域主要涵盖北方大花生区、长江流域春、夏花生交作区、南方春秋两熟花生区、云贵高原花生区、黄土高原花生区、东北早熟花生区及西北内陆花生区，其中北方大花生区的种植面积最大，占全国花生面积的50%以上。

花生具有极高的营养价值与经济价值，在人们的日常生活和工业生产中都扮演着重要角色。在食用方面，花生仁富含脂肪、蛋白质，不仅是营养丰富的直接食用食品，还可用于制作糖果、点心等各类美食；在油料领域，花生是优质食用油的主要油料品种之一，花生油不仅可供人们日常食用，还可作为工业原料，油渣也可制成副食品或用作饲料；在工业用途上，花生在纺织工业中可用作润滑剂，在机械制造工业中可用作淬火剂，花生壳还因其富含丰富的纤维素，成为饲用酵母、酒精及糖醛等的生产原料。在我国主要油料作物中，花生种植面积仅次于大豆和菜籽，位居第三，同时它也是唯一能够实现自给自足的油料作物。我国在花生的育种技术和种植水平方面处于世界先进地位，拥有多达6000个花生品种，单产水平远超其他油脂油料作物，在种植面积和总产量方面，我国在世界范围内也具有显著优势，花生产量占世界花生总产量的将近四成，长期稳居全球第一位，这充分体现了花生在我国农业经济中的重要地位。

随着人们生活水平的提高和对农产品品质要求的日益增加，花生育种和遗传改良工作变得愈发重要。传统的花生育种主要依赖于表型选择，但这种方法存在一定的局限性，如周期长、效率低，且易受环境因素影响。随着现代分子生物学技术的飞速发展，分子标记技术为花生育种提供了新的手段。微卫星DNA，又称简单序列重复（SimpleSequenceRepeat，SSR）或短串联重复序列（ShortTandemRepeat，STR），是近年来发展起来的一种重要的DNA分子标记。微卫星DNA以少数几个核苷酸（一般为1-6个）为单位串联重复，其重复次数和重复程度在不同个体间高度变化，且随机分布于真核生物基因组中。与其他分子标记相比，微卫星DNA具有诸多优点。它在基因组内含量丰富且分布广泛、均匀，多态性丰富，能够提供大量的遗传信息；呈孟德尔共显性遗传，这使得在遗传分析中可以清晰地区分纯合型和杂合型；检测快速方便，单个位点检测时间通常不超过24h，还可以同时对多个位点进行检测，大大提高了检测效率；结果稳定可靠，为遗传研究提供了稳定的数据支持；此外，微卫星侧翼序列具有保守性，某些情况下，某一物种的微卫星引物可应用于相近物种，增加了其通用性。

在植物遗传研究中，微卫星DNA已被广泛应用于多个方面。在构建遗传图谱方面，以微卫星位点为基础，在基因组中每隔一定距离选取一个多态的微卫星标记，当这些标记达到一定饱和度时，即可构建出高精度的遗传连锁图，随着标记数量的增加，遗传图谱的精确度也会不断提高；在基因定位中，利用微卫星与功能基因和数量性状基因座（QuantitativeTraitLocus，QTL）间的连锁关系，能够准确确定功能基因在染色体上的位置及其效应，例如通过微卫星位点，可将控制奶牛体细胞评分的QTL定位于牛的23号染色体上，将牛的双肌基因MH定位于牛的2号染色体上；在遗传多样性评估中，通过分析微卫星DNA的多态性，可以准确度量群体遗传变异，计算遗传距离和遗传纯度，了解物种或品种间的遗传关系，这对于种质资源的收集、保存和利用具有重要指导意义；在分子标记辅助育种中，微卫星标记能够在育种早期排除那些非必需染色体区段，有目的地导入有利基因，剔除不利基因，增大选择强度，定向培育新品种、品系或品系群，从而有效缩短育种年限和降低选育成本。

然而，尽管花生在农业经济中占据重要地位，但由于其基因组高度保守，在DNA分子水平上的差异十分有限，这给花生的遗传研究和品种改良带来了一定挑战。因此，深入开展花生微卫星DNA的研究，开发更多有效的微卫星标记，对于揭示花生的遗传多样性、构建高密度的遗传图谱、定位重要农艺性状相关基因以及开展分子标记辅助育种等具有重要意义。通过对花生微卫星DNA的分离与多态性研究，能够为花生育种提供更丰富的遗传信息和更精准的分子标记，有