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专业术语高通量测序数据分析化方法优缺评价
1.序列比对方法
BLAST(BasicLocalAlignmentSearchTool)
优点:操作简单,使用方便,能快速在大型数据库中找到相似序列,广泛应用于物种鉴定、基因功能预测等。对序列的长度和质量要求相对较低,能处理不同长度的序列片段。有多种版本和在线工具可供使用,易于获取。
缺点:对于高度相似序列的区分能力有限,灵敏度不够高,可能会遗漏一些低相似度但有重要生物学意义的匹配。比对速度在处理大规模数据时会变慢,尤其是在面对高通量测序产生的海量数据时效率较低。
Bowtie
优点:速度极快,特别适合处理高通量测序数据,能在短时间内
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