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生物信息学分析师基因测序数据处理题库
一、单选题（每题2分，共20分）
1.在基因测序数据中，通常使用的碱基字母不包括（）
A.AB.TC.GD.CE.U
2.对于高通量测序数据，以下哪种质量控制工具通常不用于去除低质量的读长（）
A.FastQCB.TrimmomaticC.SamtoolsD.Cutadapt
3.在基因表达分析中，以下哪个软件包主要用于差异表达基因的识别（）
A.BLASTB.BowtieC.DESeq2D.Hadoop
4.在序列比对中，以下哪种算法通常用于局部比对（）
A.Smith-WatermanB.Needleman-WunschC.BLASTD.Smith-WatermanandNeedleman-Wunsch
5.在基因注释过程中，以下哪个数据库通常不用于获取基因功能信息（）
A.GeneOntologyB.UniProtC.NCBIGeneD.PDB
6.在RNA-Seq数据分析中，以下哪个步骤通常不涉及对原始测序数据的预处理（）
A.QualitycontrolB.AlignmentC.GeneexpressionquantificationD.Denovoassembly
7.在基因组组装中，以下哪种方法通常用于大规模基因组测序数据的组装（）
A.ContigassemblyB.DenovoassemblyC.Reference-basedassemblyD.Hybridassembly
8.在变异检测中，以下哪个工具通常不用于检测SNP和InDel（）
A.GATKB.SamtoolsC.FreeBayesD.VarScan
9.在蛋白质组学数据分析中，以下哪个数据库通常不用于获取蛋白质序列信息（）
A.UniProtB.PDBC.NCBIProteinD.GO
10.在系统发育分析中，以下哪种方法通常不用于构建进化树（）
A.Neighbor-JoiningB.MaximumLikelihoodC.BayesianinferenceD.Multiplesequencealignment
二、多选题（每题4分，共20分）
1.以下哪些工具可以用于基因测序数据的质量控制（）
A.FastQCB.TrimmomaticC.SamtoolsD.Cutadapt
2.在RNA-Seq数据分析中，以下哪些步骤通常涉及对原始测序数据的预处理（）
A.QualitycontrolB.AlignmentC.GeneexpressionquantificationD.Denovoassembly
3.在基因组组装中，以下哪些方法可以用于大规模基因组测序数据的组装（）
A.ContigassemblyB.DenovoassemblyC.Reference-basedassemblyD.Hybridassembly
4.在变异检测中，以下哪些工具可以用于检测SNP和InDel（）
A.GATKB.SamtoolsC.FreeBayesD.VarScan
5.在系统发育分析中，以下哪些方法可以用于构建进化树（）
A.Neighbor-JoiningB.MaximumLikelihoodC.BayesianinferenceD.Multiplesequencealignment
三、填空题（每题4分，共40分）
1.在基因测序数据中，通常使用的碱基字母包括______、______、______和______。
2.对于高通量测序数据，常用的质量控制工具包括______、______和______。
3.在基因表达分析中，常用的差异表达基因识别软件包包括______。
4.在序列比对中，常用的局部比对算法包括______。
5.在基因注释过程中，常用的数据库包括______、______和______。
6.在RNA-Seq数据分析中，常用的步骤包括______、______和______。
7.在基因组组装中，常用的方法包括______、______和______。
8.在变异检测中，常用的工具包括______、______和______。
9.在蛋白质组学数据分析中，常用的数据库包括______、______和______。
10.在系统发育分析中，常用的方法包括______、______和______。
四、判断题（每题2分，共20分）
1.在基因测序数据中，通常使用的碱基字母包括A、T、G和C。（）
2.FastQC主要用于去除低质量的读长。（）
3.DESeq2主要用于差异表达基因的识别。（）
4.Smith-Waterman算法通常用于局部比对。（）
5.GeneOntology主要用于获取基因功能信息。（）
6.RNA-Seq数据分析通常涉及对原始测序数据的预处理。（）
7.基因组组装通常使用D
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