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作物学报ACTAAGRONOMICASINICA2025,51(3):586597/
ISSN0496-3490;CN11-1809/S;CODENTSHPA9E-mail:zwxb301@
DOI:10.3724/SP.J.1006.2025.44112
谷子SHMT基因家族全基因组鉴定与表达分析
郭冰1秦家范3李娜1宋梦瑶1王黎明1李君霞2,*马小倩1,*
1河南科技大学农学院,河南洛阳471023;2河南省农业科学院粮食作物研究所,河南郑州450002;3洛阳市农林科学院,河南洛阳
471023
摘要:丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)在作物中广泛存在,参与作物碳代谢、光呼吸等途径,在作物生长发育及抗逆
胁迫中发挥重要作用,但是目前关于谷子SHMT基因的研究较少。本研究在全基因组水平鉴定了谷子SHMT基因家
族成员,系统分析了SiSHMTs的基因结构、进化关系、染色体定位、物种间共线性、顺式作用元件、表达模式、优
势单倍型等。结果表明,谷子中共有5个SiSHMTs,分子量在51.70~64.37kD之间,空间结构相近,进化关系将其分
为3组,每组成员散落在各条染色体上。启动子顺式作用元件分析发现,在启动子中包含多个光反应响应元件、厌氧
响应元件、激素响应元件等作用元件。物种间共线性分析结果表明,SiSHMT3和SiSHMT4与单子叶作物水稻、小麦、
高粱、玉米存在共线性,SiSHMT3与水稻、小麦、玉米存在多个共线对。SiSHMT成员在谷子不同发育时期、不同组
织中表达量不同,SiSHMT4表达量较高,在穗发育过程持续高表达,并受到干旱、盐和ABA的显著诱导。SiSHMT4
单倍型分析显示,Hap1为优势单倍型,在穗长、穗宽、穗重各表型中都显著优于其他单倍型。研究结果为挖掘谷子
抗旱、耐盐新功能基因提供基因源,为今后选择培育高产抗逆谷子新品种奠定理论基础。
关键词:谷子;SHMTs;基因家族;生长发育;非生物胁迫
Genome-wideidentificationandexpressionanalysisofSHMTgenefamilyin
foxtailmillet(SetariaitalicaL.)
131112,*1,*
GUOBing,QINJia-Fan,LINa,SONGMeng-Yao,WANGLi-Ming,LIJun-Xia,andMAXiao-Qian
1CollegeofAgriculture,HenanUniversityofScienceandTechnology,Luoyang471023,Henan,China;2CerealCropsInstitute,HenanAcademyof
AgriculturalSciences,Zhengzhou450002,Henan,China;3LuoyangAcademyofAgriculturalandForestryScien
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