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最优化方法赋能生物序列比对：算法革新与应用拓展

一、引言

1.1研究背景与意义

生物信息学作为一门融合生物学、计算机科学和数学等多学科知识的交叉领域，在现代生命科学研究中发挥着举足轻重的作用。而生物序列比对，作为生物信息学的核心技术之一，更是贯穿于基因组学、蛋白质组学、系统生物学等多个重要研究方向。它通过比较DNA、RNA或蛋白质序列，寻找序列之间的相似性和差异性，从而揭示生物分子的结构、功能以及进化关系。

随着高通量测序技术的飞速发展，生物序列数据呈爆炸式增长。从早期的人类基因组计划，到如今海量的物种基因组测序，以及不断涌现的转录组、蛋白质组数据，这些数据的积累为生命科学研究带来了前所