利用SSR标记分析普通野生稻遗传多样性.pdfVIP

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广东农业科学GuangdongAgriculturalSciences2024,51(11):28-38DOI:10.16768/j.issn.1004-874X.2024.11.003

董超,张斐斐,汤翠凤,阿新祥,甘树仙,杨雅云,刘自单,戴陆园.利用SSR标记分析普通野生稻遗传多样性[J].广东农业科学,2024,51(11):

28-38.

DONGChao,ZHANGFeifei,TANGCuifeng,AXinxiang,GANShuxian,YANGYayun,LIUZidan,DAILuyuan.Geneticdiversityanalysisofcommonwildriceby

usingSSRmarkers[J].GuangdongAgriculturalSciences,2024,51(11):28-38.

专题:野生稻研究

董超,硕士,云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所副研究员,“农业农村部云南及周边作物

种质资源评价创新团队”核心成员,云南省技术创新人才培养对象,云南省科技特派员。主要从

事稻种资源收集与评价、基因挖掘与创新利用及绿色超级稻新品种选育研究。主持或参与国家及

省级项目8项;以主要完成人承担农业农村部平台建设项目3项。在《PlantDisease》《Rice》《中

国水稻科学》《植物遗传资源学报》等期刊发表学术论文30余篇;获授权国家发明专利1件、实

用新型专利7件,软件著作权5项,审定水稻新品种1个,获植物新品种保护权3项;收集入库

保存云南及周边作物种质资源3000余份,鉴定评价与创制绿色新种质2000余份,对外提供利用

1245份次;选育的新品种‘云资红23号’‘云资粳25号’获云南省作物学会首届优质米品鉴金奖。

利用SSR标记分析普通野生稻遗传多样性

11112111

董超,张斐斐,汤翠凤,阿新祥,甘树仙,杨雅云,刘自单,戴陆园

(1.云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/

农业农村部西南作物基因资源与种质创制重点实验室,云南昆明650223;

2.西双版纳傣族自治州农业科学研究所,云南西双版纳666100)

摘要:【目的】揭示中国云南景洪、云南元江、江西东乡、缅甸普通野生稻(OryzarufipogenGriff.)遗传多样性,

以及云南景洪和元江普通野生稻原、异位保存下变异情况。【方法】利用36对SSR标记对来自云南景洪异位保护

与原位保护区、云南元江异位保护与原位保护区、江西东乡及缅甸共102份普通野生稻进行检测,开展不同地理来

源及不同保存方式下普通野生稻居群遗传多样性比较与聚类分析。【结果】供试普通野生稻检测出等位变异(Na)

110个,平均3.056个,变幅为1~5个;Neis基因多样性指数(I)平均为0.448。不同地理来源Nei’s基因多样性指

数大小为:缅甸(0.561)云南景洪(0.437)云南元江(0.236)江西东乡(0.230),云南景洪和元江的普通

野生稻Nei’s基因多样性指数均表现为异位保护区大于原位保护区(云南景洪:0.4980.131,云南元江:0.2640.035)。

聚类与遗传分化分析显示,供试材料平均遗传相似系数为0.772,变幅0.260~1.000;在遗传相似系数0.635处可将

供试材料划分为云南景洪、云南元江、江西东乡及缅甸居群。云南景洪原位保护区与缅甸的普通野生稻遗传距离较

近(0.560),云南元江原位保护区与江西东乡的普通野生稻遗传距离较近(0.552);而云南元江原位保护区与景

洪原位保护区的普通

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