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2025-10-11 发布于北京
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多肽设计原理和方法课件.ppt

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多肽设计原则和方法1.

多肽抗原的特点含有的epitope数目少；抗原性比融合蛋白弱；产生的抗原特异性通常比融合蛋白强；是一种半抗原，需要连接载体蛋白；2.

多肽设计的原则Hydrophilicity,tobesuretheantigenisonthesurfaceoftheprotein.Antigenicity,aminoacidprovidesgoodbonds.N-orC-terminalpeptide,fortheyareexposedinmostproteins.ContainsMHCIIpreferredmotifs.SuchasD,Y,P,andFwhoappearsinMHCmoleculesmostfrequently.Nohomologywithotherproteinsbyblast.Preferthecytoplasmicdomainforatransmembraneprotein,fortheyaremoreimmunogenicAvoidglycosylationandphosphorylationsitesifpossibleAvoidcystininthemiddlepartofthepeptide3.

20种氨基酸的抗原性比较L0.75K-0.05H0.65P-0.05D0.31R-0.07T0.21W-0.11A0.12C-0.12E0.06N-0.14Y0.01G-0.18V-0.01M-0.38S-0.01F-0.77Q-0.03I-2.924.

什么时候选用多肽做抗原我们没有基因的抗原；有基因，但是蛋白质和其他蛋白质有较强的同源性，或者蛋白质属于同源性较强的蛋白家族；有基因，需要区分该基因编码的蛋白质加工后的不同亚型；抗原是修饰蛋白质，包括磷酸化，乙酰基化蛋白质等5.

案例1我们没有的蛋白质NM_004445，EPHB6MATEGAAQLGNRVAGMVCSLWVLLLVSSVLALEEVLLDTTGETSEIGWLTYPPGGWDEVSVLDDQRRLTRTFEACHVAGAPPGTGQDNWLQTHFVERRGAQRAHIRLHFSVRACSSLGVSGGTCRETFTLYYRQAEEPDSPDSVSSWHLKRWTKVDTIAADESFPSSSSSSSSSSSAAWAVGPHGAGQRAGLQLNVKERSFGPLTQRGFYVAFQDTGACLALVAVRLFSYTCPAVLRSFASFPETQASGAGGASLVAAVGTCVAHAEPEEDGVGGQAGGSPPRLHCNGEGKWMVAVGGCRCQPGYQPARGDKACQACPRGLYKSSAGNAPCSPCPARSHAPNPAAPVCPCLEGFYRASSDPPEAPCTGPPSAPQELWFEVQGSALMLHWRLPRELGGRGDLLFNVVCKECEGRQEPASGGGGTCHRCRDEVHFDPRQRGLTESRVLVGGLRAHVPYILEVQAVNGVSELSPDPPQAAAINVSTSHEVPSAVPVVHQVSRASNSITVSWPQPDQTNGNILDYQLRYYDQAEDESHSFTLTSETNTATVTQLSPGHIYGFQVRARTAAGHGPYGGKVYFQTLPQGELSSQLPERLSLVIGSILGALAFLLLAAITVLAVVFQRKRRGTGYTEQLQQYSSPGLGVKYYIDPSTYEDPCQAIRELAREVDPAYIKIEEVIGTGSFGEVRQGRLQPRGRREQTVAIQALWAGGAESLQMTFLGRAAVLGQFQHPNILRLEGVVTKSRPLMVLTEFMELGPLDSFLRQREGQFSSLQLVAMQRGVAAAMQYLSSFAFVHRSLSAHSVLVNSHLVCKVARLGHSPQGPSCLLRWAAPEVIAHGKHTTSSDVWSFGILMWEVMSYGERPYWDMSEQEVLNAIEQEFRLPPPPGCPPGLHLLMLDTWQKDRARRPHFDQLVAAFDKMIRKPDTLQAGGDPGERPSQALLTPVALDFPCLDSPQAWLSAIGLECYQDNFSKFGLCTFSDVAQLSLEDLPALGITLAGHQKKLLHHIQLLQQHLRQQGSVEV共1021aa，N-15aa为信号肽6.

案例1我们没有的蛋白质（2）WDEVSVLDDQRRLTRTFEAC7.

案例1我们没有的蛋白质（3）GENEID:2051EPHB6|EPHr

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