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基于分子标记技术的茄子遗传连锁图谱构建及果实性状QTL定位研究

一、引言

1.1研究背景与意义

茄子（SolanummelongenaL.）作为茄科茄属的重要蔬菜作物，在全球蔬菜生产和消费中占据着重要地位。它不仅是人们日常饮食中常见的食材，具有丰富多样的烹饪方式，能满足不同消费者的口味需求，还富含蛋白质、脂肪、碳水化合物、维生素以及钙、磷、铁等多种营养成分，具有一定的保健功效，对人体健康大有裨益。

随着人们生活水平的提高和消费观念的转变，对茄子的品质、产量和抗病性等方面提出了更高的要求。传统的茄子育种主要依赖于表型选择，这种方法周期长、效率低，且易受环境因素的影响。而现代分子生物学技术的发展，为茄子育种提供了新的途径。

遗传连锁图谱是基因定位、克隆以及分子标记辅助育种的重要基础。通过构建茄子遗传连锁图谱，可以将茄子的基因定位在染色体上，明确基因之间的相对位置和遗传距离，从而为深入了解茄子的遗传机制提供有力工具。果实性状是茄子重要的经济性状，包括单果质量、果长、果径、果形指数和果实花萼大小等。这些性状直接影响茄子的商品价值和市场竞争力。通过对茄子果实性状进行QTL（QuantitativeTraitLocus）定位，能够确定与这些性状相关的基因位点，揭示其遗传规律，为茄子的分子标记辅助育种提供理论依据和技术支持。这不仅可以加速茄子新品种的选育进程，提高育种效率，还能培育出更符合市场需求的优质茄子品种，对于推动茄子产业的发展具有重要意义。

1.2国内外研究现状

在茄子遗传连锁图谱构建方面，国内外学者已开展了大量研究工作。早期主要利用RFLP（RestrictionFragmentLengthPolymorphism）、RAPD（RandomAmplifiedPolymorphicDNA）等分子标记技术构建图谱，但这些标记存在多态性低、稳定性差等缺点。随着分子生物学技术的不断发展，SSR（SimpleSequenceRepeat）、SNP（SingleNucleotidePolymorphism）等新型分子标记逐渐被广泛应用于茄子遗传连锁图谱的构建。如一些研究者使用SSR标记序列展开茄子遗传图谱的构建，成功将多个标记分配到不同连锁群上。浙江省农科院蔬菜所魏庆镇博士利用百迈客SLAF测序技术，对茄子种间分离F2群体测序并构建了包含2122个SNP标记与12条连锁群的高密度遗传图谱，遗传总图距为1530.75cM，平均图距为0.72cM，为茄子的遗传研究提供了更精细的图谱资源。

在茄子果实性状QTL定位方面，也取得了一定进展。葛海燕等人以果实性状差异显著的茄子种质材料绿茄‘131’和上海本地长茄‘141’为作图亲本，构建F2群体，采用SSR标记构建遗传图谱，共定位了9个与果实性状相关的QTL位点，包括单果质量、果长、果径、果形指数和果实花萼大小等性状的QTL。谢立峰等人利用重组自交系（RIL）为作图群体，构建遗传图谱，应用复合区间作图法（CIM），共检测到18个与茄子果实性状相关的QTLs，其中10个为主效QTLs。然而，目前茄子果实性状QTL定位研究仍存在一些问题，如定位的QTL位点较少、定位精度不高、不同研究结果之间的一致性较差等，需要进一步深入研究。

1.3研究目标与内容

本研究旨在构建一张高密度的茄子遗传连锁图谱，并对茄子果实相关性状进行QTL定位，具体研究内容包括：

选用果实性状差异显著的茄子种质材料作为亲本，构建F2分离群体，为后续实验提供研究材料。

利用SSR、SNP等分子标记技术，对F2群体进行基因型分析，筛选出多态性高、稳定性好的分子标记。

运用遗传图谱构建软件，将筛选出的分子标记进行连锁分析，构建茄子遗传连锁图谱，优化图谱的密度和质量。

对F2群体的果实单果质量、果长、果径、果形指数和果实花萼大小等性状进行表型鉴定，收集数据并进行统计分析。

采用复合区间作图法等QTL定位方法，结合基因型和表型数据，对茄子果实相关性状进行QTL定位，确定相关QTL位点在染色体上的位置和效应，为茄子分子标记辅助育种提供理论依据和基因资源。

二、茄子遗传连锁图谱构建

2.1实验材料与方法

2.1.1实验材料选择

本研究选用果实性状差异显著的茄子种质材料‘绿茄131’和‘上海本地长茄141’作为亲本。‘绿茄131’果实呈绿色，单果质量较大，果形较为短粗；‘上海本地长茄141’果实为紫色，单果质量相对较小，果形细长。二者在果实的颜色、大小、形状等方面表现出明显差异，这使得在杂交后代中能够更容易地观察和分析果实性状的遗传分离情况。以这两个亲本进行杂交，获得F1代种子，然后通过