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基于SSR标记解析彩色马铃薯亲缘关系与指纹图谱构建研究

一、引言

1.1研究背景与意义

马铃薯（SolanumtuberosumL.）作为全球第四大重要粮食作物，具有产量高、适应性强、营养丰富等特点，在保障全球粮食安全和促进农业经济发展中发挥着关键作用。彩色马铃薯作为马铃薯家族中的特殊成员，因其块茎富含花青素、类黄酮等抗氧化物质，呈现出红、紫、蓝等独特颜色，不仅具有普通马铃薯的营养价值，还具有抗氧化、抗炎、预防心血管疾病等多种保健功能，逐渐成为研究热点和市场新宠。

在农业领域，深入了解彩色马铃薯种质资源的遗传背景和亲缘关系，对于其品种选育、遗传改良和种质资源保护至关重要。准确解析亲缘关系可以避免近亲杂交，拓宽遗传基础，为培育高产、优质、抗病的彩色马铃薯新品种提供理论依据。同时，构建彩色马铃薯指纹图谱，如同为每个品种赋予独特的“基因身份证”，在品种鉴定、知识产权保护、种子质量检测等方面具有不可替代的作用，能够有效防止品种混杂和假冒伪劣种子流通，维护育种者和农民的合法权益。

SSR（SimpleSequenceRepeat）标记技术，又称微卫星标记，是基于DNA序列多态性的分子标记技术。其具有多态性高、重复性好、共显性遗传、分布均匀、检测方便等优点，已广泛应用于植物遗传多样性分析、亲缘关系鉴定、遗传图谱构建等研究领域。在彩色马铃薯研究中，利用SSR标记可以快速、准确地揭示不同品种（系）之间的遗传差异和亲缘关系，为种质资源评价和利用提供有力工具；构建的SSR指纹图谱具有高度特异性和稳定性，能够实现彩色马铃薯品种的精准鉴别和追踪，为种质资源管理和保护提供科学手段。因此，开展基于SSR标记的彩色马铃薯亲缘关系分析及指纹图谱构建研究，对于推动彩色马铃薯产业可持续发展具有重要的理论和实践意义。

1.2国内外研究现状

国内外对彩色马铃薯的研究涵盖了多个方面。在品种资源方面，国外如英国、美国、日本等国家较早开展彩色马铃薯育种工作，培育出众多特色品种，如英国的紫黑色皮肉Congo、Negresse和KingEdward品种；美国的RedNorlandhe和DarkRedNorland品种；日本的NorthernRuby品种等。国内自20世纪90年代开始重视彩色马铃薯育种，云南省农业科学院马铃薯研发中心通过杂交改良筛选出200多种不同品系，宁夏农林科学院固原分院也成功筛选出5个彩色马铃薯优势品系，包括紫皮紫肉的“六盘紫晶”、红皮红肉的“火晶薯”等。

在遗传特性研究中，科学家们对马铃薯颜色形成的遗传机制进行了大量探索。已知大多数马铃薯栽培种中的花青素合成受I、P和R三个基因共同调控，I基因是花青素在块茎皮中组织专一性表达所必需，P基因负责调控紫色花青素产生，R基因负责调控红色花青素产生，且P对R具有上位性。但由于遗传机制复杂，尚未形成统一结论。

在亲缘关系分析和指纹图谱构建领域，SSR标记技术得到广泛应用。段艳凤等利用SSR标记构建了中国2000-2007年审定的88个马铃薯品种的指纹图谱并进行遗传多样性分析；王若秋等选用22对SSR标记引物，对33份彩色马铃薯品种(系)进行遗传多样性分析及指纹图谱构建，发现22对引物可扩增得到95个等位位点，多态性比率达86.31％，并利用5对引物构建了分子标记指纹图谱。然而，当前研究仍存在不足，如对彩色马铃薯野生资源与栽培品种亲缘关系研究较少，部分SSR标记通用性和稳定性有待提高，指纹图谱数据库建设尚不完善，难以满足大规模品种鉴定和种质资源管理需求。

1.3研究目标与内容

本研究旨在利用SSR标记技术，深入解析彩色马铃薯种质资源的亲缘关系，构建准确、高效的指纹图谱，为彩色马铃薯遗传改良、品种鉴定和种质资源保护提供科学依据和技术支持。具体研究内容如下：

材料选取：广泛收集具有代表性的彩色马铃薯品种（系），包括国内外不同生态区域、不同育种背景的材料，确保研究对象的遗传多样性和广泛性。

SSR标记分析：筛选多态性高、稳定性好的SSR引物，对收集的彩色马铃薯材料进行PCR扩增，检测等位基因变异，分析遗传多样性参数，如多态性位点比率、多态信息量（PIC）等，评估不同材料间的遗传差异。

指纹图谱构建：基于SSR标记数据，采用合适的数据分析方法，构建彩色马铃薯指纹图谱，确定每个品种（系）的特征指纹，实现品种的快速准确鉴别。

亲缘关系与结果分析：运用聚类分析、主成分分析等方法，对彩色马铃薯材料的遗传关系进行系统分析，绘制亲缘关系树状图和主成分分析图，明确不同品种（系）间的亲缘关系远近，探讨其遗传演化规律，并对指纹图谱的准确性和可靠性