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水稻白条纹新基因st9(t)的定位解析与功能关联研究

一、引言

1.1研究背景

水稻（OryzasativaL.）作为全球最重要的粮食作物之一，是全球约一半人口的主食，尤其在亚洲、非洲和拉丁美洲等地，对保障粮食安全起着不可替代的作用。在中国，水稻的种植历史源远流长，种植范围广泛，是主要的粮食作物，在维护国家粮食安全方面具有举足轻重的战略地位。据统计，全球水稻种植面积达1.6亿公顷，年总产量超过7亿吨，为全球粮食供应做出了重要贡献。

然而，水稻在生长过程中会遭遇各种生物和非生物胁迫，其中水稻白条纹病是一种对水稻产量和品质影响较为严重的病害。水稻白条纹病在全球稻区普遍存在，一旦发生，可导致水稻减产10%-30%，严重时甚至绝收。该病害主要由病毒或基因突变引起，发病时水稻叶片上会出现白色条纹，严重影响叶片的光合作用。从生理层面来看，白条纹的出现往往伴随着叶绿体发育异常，导致叶绿素合成受阻。叶绿素是光合作用中捕获光能的重要色素，叶绿素合成不足使得光合作用效率大幅降低。研究表明，许多白条纹突变体的叶绿素含量相较于野生型水稻显著下降，这直接影响了光反应中光能的吸收、传递和转化，进而影响了暗反应中二氧化碳的固定和有机物的合成。例如，在对水稻白条纹突变体gws的研究中发现，该突变体叶绿素及叶绿素合成中间产物含量都降低，光合效率明显下降。

在过去的研究中，虽然已经鉴定出一些针对水稻白条纹病的抗病基因，但是这些基因并不能完全控制白条纹病的发生和传播。随着全球气候的变化以及种植环境的改变，水稻白条纹病的发生呈现出愈发复杂和严重的趋势，给水稻生产带来了严峻挑战。因此，寻找新的抗病基因对于防治水稻白条纹病、保障水稻产量和品质具有重要意义。

1.2研究目的与意义

本研究旨在通过一系列实验手段，初步定位水稻白条纹新基因st9(t)，确定其在水稻染色体上的大致位置。具体来说，将利用合适的水稻遗传材料构建定位群体，通过对突变体的表型观察、遗传分析以及分子标记技术，筛选与目标基因紧密连锁的分子标记，从而将st9(t)基因定位在水稻染色体的特定区间。

这一研究具有重要的理论和实践意义。在理论方面，初步定位水稻白条纹新基因st9(t)，能够为后续深入研究该基因的克隆、功能解析以及揭示水稻白条纹性状形成的分子机制奠定基础，有助于丰富对水稻生长发育和抗病性分子机制的认识，进一步完善水稻遗传学理论体系。在实践方面，明确st9(t)基因的位置后，可为水稻分子标记辅助育种提供重要的基因资源和标记信息，加速培育具有抗白条纹病能力的水稻新品种，提高水稻的抗病性和产量，减少因病害导致的经济损失，对于保障全球粮食安全具有重要的现实意义。

1.3国内外研究现状

国内外对水稻白条纹病及相关基因的研究取得了一定成果。在水稻白条纹病的致病机制研究方面，已经明确水稻条纹病毒（RSV）是导致水稻条纹叶枯病的主要病原之一，其通过介体灰飞虱以持久性方式经卵传播，寄主范围广泛，能侵染水稻、小麦、大麦、玉米等80多种禾本科植物。RSV侵染水稻后，会导致水稻叶片出现褪绿的条纹斑点或斑块，严重影响水稻的光合作用和生长发育。

在相关基因的研究上，通过图位克隆、基因编辑等技术手段，已经成功克隆和鉴定了多个与白条纹性状相关的基因。例如，LiX等人克隆并鉴定了whitestripeleaf-10基因，该基因的突变导致了水稻叶片出现白条纹表型。研究发现，这些基因在调控叶绿体发育、叶绿素合成以及植物的生长发育和抗病过程中发挥着关键作用。一些基因编码的蛋白参与了叶绿体的生物发生和发育过程，突变后导致叶绿体结构和功能异常，从而引发白条纹表型；另一些基因则参与了叶绿素合成途径中的关键步骤，突变后影响了叶绿素的合成，导致叶片出现白色条纹。

然而，现有研究仍存在不足。一方面，虽然已经鉴定了一些白条纹相关基因，但对于这些基因之间的相互作用网络以及它们如何协同调控白条纹性状的形成，还缺乏深入了解。另一方面，目前已发现的抗病基因在实际应用中存在局限性，难以完全满足生产上对水稻白条纹病有效防治的需求。因此，继续挖掘新的白条纹相关基因，并深入研究其功能和作用机制，具有重要的理论和实践价值，这也凸显了本研究初步定位水稻白条纹新基因st9(t)的创新性和必要性。

二、材料与方法

2.1试验材料

选用野生型水稻品种日本晴（OryzasativaL.ssp.japonicacv.Nipponbare）作为对照材料，其种子购自中国农业科学院作物科学研究所，该品种具有遗传背景清晰、生长周期稳定等特点，广泛应用于水稻遗传学研究。同时，选用在田间自然条件下发现的具有白条纹性状的水稻突变体材料6001，该突变体由本实验室保存。

为了构建用于基因定位的群体，以日本晴