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肠上皮化生生物标志物的基因芯片与代谢组学分析
目录
肠上皮化生生物标志物的基因芯片与代谢组学分析（1）．．．．．．．．．．4
一、项目背景与概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
1.1肠上皮化生概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5
1.2生物标志物在疾病诊断中的应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6
1.3基因芯片与代谢组学技术在医学研究中的应用．．．．．．．．．．．．．．．7
二、实验设计与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9
2.1样本选择与采集．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11
2.1.1患者样本选择标准．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12
2.1.2样本采集方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13
2.2基因芯片技术平台构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14
2.2.1基因芯片设计．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15
2.2.2芯片制作流程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17
2.3代谢组学分析技术流程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19
2.3.1样本预处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20
2.3.2代谢物检测与鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22
2.3.3数据分析方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24
三、肠上皮化生生物标志物筛选与鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24
3.1基因芯片数据分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26
3.1.1原始数据处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27
3.1.2差异基因筛选．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30
3.1.3生物标志物鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31
3.2代谢组学数据分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33
3.2.1代谢物定量分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36
3.2.2差异代谢物筛选．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37
3.2.3代谢途径分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40
四、肠上皮化生生物标志物验证与应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．41
4.1生物标志物验证实验．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43
4.1.1实验设计．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．44
4.1.2验证方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．45
4.1.3验证结果分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．47
4.2生物标志物的临床应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．52
肠上皮化生生物标志物的基因芯片与代谢组学分析（2）．．．．．．．．．53
内容概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．53
1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．54
1.1.1肠上皮化生概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．56
1.1.2生物标志物在疾病诊断中的应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．58
1.2国内外研究现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．59
1.2.1肠上皮化生相关基因研究进展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．63
1.2.2肠上皮化生相
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