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第33卷第3期激光生物学报Vol.33No.3
2024年6月ACTALASERBIOLOGYSINICAJun.2024
国产遗传分析仪测序模块优化设计研究
*
12,31114441
管桦,张建,阮德林,张欣欣,张涛,杨丽萍,张宁杰,闫梁,贾二惠
(1.公安部第一研究所,北京100048;2.公安部鉴定中心,北京100038;3.西安交通大学生物证据研究院,
国家生物安全证据基地,西安710049;4.北京中盾安民分析技术有限公司,北京102200)
cm
本文使用国产24道遗传分析仪搭配国产36毛细管阵列,解决无胶筛分毛细管电泳技术为基础的遗
摘要:
传分析仪在测序中荧光信号校正、运行电压、迁移校正问题。以24道遗传分析仪原始光谱荧光信号为基础,建立
光谱校正模型,获得基线噪声阈值。通过运行电压与峰间距值绘制标准曲线,利用测序分析软件计算清晰片段长
度,确定最佳运行电压和峰间距,进而计算迁移偏移值,建立碱基大小与迁移时间的线性模型,实现碱基的准确识
kV.
别。研究表明,在合适的光谱校正和基线噪声阈值限制下,当运行电压设置为10,峰间距为1305帧时,分析仪
bp
的最长清晰片段检验能力最强,为561。通过迁移修正值的补偿,建立碱基大小与迁移时间的线性模型,碱基
GATCR2........
、、、的(标准曲线)值分别从09927、09927、09945、09879提高到09996、09998、09996、09997,且
bp
修正后,各个荧光标记的碱基均能得到正确标记,无漏标和错标,清晰片段长度延长到621。本研究可以指导
国产遗传分析仪测序模块的优化和设计,使分析仪的DNA碱基识别功能更高效和准确。
国产遗传分析仪;无胶筛分毛细管电泳;碱基测序;运行电压;迁移校正
关键词:
R-A.j.issn.-...
39433103969/10077146202403004
中图分类号:
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