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基因数据解读师考试试卷
一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)
以下关于二代测序(NGS)技术的描述,正确的是:
A.主要用于单基因位点验证,通量低
B.测序读长通常超过10kbp
C.基于边合成边测序(SBS)原理
D.无法检测插入缺失(Indel)变异
答案:C
解析:二代测序(NGS)的核心原理是边合成边测序(SBS),通过大规模平行测序实现高通量(A错误);其读长通常为50-300bp(B错误);可检测SNV、Indel等多种变异类型(D错误)。
在基因数据解读中,用于评估变异人群频率的常用数据库是:
A.ClinVar
B.gnomAD
C.HGMD
D.dbSNP
答案:B
解析:gnomAD是大规模人群变异频率数据库(B正确);ClinVar侧重临床意义注释(A错误);HGMD为致病突变数据库(C错误);dbSNP包含所有已知SNP但不侧重频率(D错误)。
以下哪种变异类型属于结构变异(SV)?
A.单碱基替换(c.123AT)
B.3个碱基的缺失(c.456delGAT)
C.100kbp的基因重复(chr1:100000-200000dup)
D.密码子插入(c.789_790insT)
答案:C
解析:结构变异通常指长度50bp的基因组重排(C正确);A为SNV,B和D为小Indel(均50bp,属于短变异)。
常染色体隐性遗传病的致病条件是:
A.杂合变异(一个等位基因变异)
B.纯合或复合杂合变异(两个等位基因均变异)
C.父源或母源单亲二倍体
D.三倍体(三个等位基因)
答案:B
解析:常隐遗传病需两个等位基因均致病(B正确);杂合通常为携带者(A错误);单亲二倍体可能导致隐性致病但非典型条件(C错误);三倍体罕见且非常隐主要机制(D错误)。
基因数据质量控制中,“覆盖度”通常指:
A.目标区域中被测序覆盖的碱基比例
B.每个碱基的平均测序深度
C.测序错误率(Q30值)
D.比对到参考基因组的reads比例
答案:A
解析:覆盖度指目标区域中至少被测序一次的碱基占比(A正确);平均深度是每个碱基的测序次数(B错误);Q30是测序准确性指标(C错误);比对率是数据比对效率(D错误)。
以下功能预测工具中,用于评估错义变异致病性的是:
A.SIFT
B.LOFTEE
C.Manta
D.GATK
答案:A
解析:SIFT(SortingIntolerantFromTolerant)专门预测错义变异对蛋白质功能的影响(A正确);LOFTEE评估功能丧失变异(B错误);Manta是结构变异检测工具(C错误);GATK是变异检测流程工具(D错误)。
根据ACMG指南,“人群数据库中未收录该变异(PM2)”属于以下哪类证据?
A.极高频致病性(PVS1)
B.强致病性(PS)
C.中等致病性(PM)
D.支持致病性(PP)
答案:C
解析:ACMG将PM(中等证据)包括人群频率极低或未收录(PM2)(C正确);PVS1为功能丧失变异(如无义突变)(A错误);PS为同源基因或功能实验支持(B错误);PP为共分离等(D错误)。
基因检测报告中“意义未明变异(VUS)”的定义是:
A.已明确致病性的变异(如ClinVar中Pathogenic)
B.已明确良性的变异(如gnomAD中频率5%)
C.证据不足以分类为致病或良性的变异
D.仅在家系中出现但无功能证据的变异
答案:C
解析:VUS指现有证据无法确定临床意义的变异(C正确);A为致病(Pathogenic),B为良性(Benign),D可能属于VUS但非定义核心。
以下哪项是基因数据解读中伦理规范的核心要求?
A.优先报告所有检测到的变异
B.无需获得受检者知情同意
C.保护受检者隐私和数据安全
D.直接向无关第三方共享数据
答案:C
解析:伦理规范要求保护隐私(C正确);需知情同意(B错误);仅报告临床相关变异(A错误);数据共享需授权(D错误)。
检测拷贝数变异(CNV)的常用生信工具是:
A.GATKHaplotypeCaller
B.CNVnator
C.ANNOVAR
D.IGV
答案:B
解析:CNVnator是专门用于CNV检测的工具(B正确);GATK用于短变异检测(A错误);ANNOVAR是注释工具(C错误);IGV是可视化工具(D错误)。
二、多项选择题(共10题,每题2分,共20分)
以下属于全基因组测序(WGS)优势的有:
A.覆盖全基因组(包括非编码区)
B.检测结构变异(如倒位、易位)能力强
C.成本低于全外显子测序(WES)
D.适合大规模单基因病筛查
答案:AB
解析:WGS覆盖全基因组(含非编码区)(A正确),能检测多种结
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