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2024微生物与感染性疾病

微生物学的科学主要关注微生物病原体及其引起的疾病。然而，每种动物

都拥有群居住在体内和体表上的微生物。这些群体中的每个被称为微

生物群落，我们现在知道健康是基于这些微生物群落与宿主之间的合作关

系。为了介绍《临床传染病》关于微生物组的特刊，我们着重讨论与这些

关系相关的5个主要观点。我们特别关注微生物群落与抗生素之间的界面,

抗生素是我们在感染疾病实践中的主要工具之。

微生物的二元性

19世纪末，医生和微生物学家开始将人类接触的微生物分为两类：病原

体（导致感染的微生物）和其他所有微生物，称为共生微生物。也有些

微生物被认为基本上是环境微生物，尽管它们可能是人类病原体，但医学

微生物学大多不考虑它们。随着疾病的病菌理论逐渐受到重视，科赫推论

为病原体的归属提供了直接的方法。尽管人们很早就对这些标准的特异性

及其局限性提出了质疑，但微生物学和医学的重点还是放在病原体上，这

也是理所当然的。当时霍乱、肺结核和伤寒等疾病肆虐，因此人们直在

寻找对付病原体的灵丹妙药。

卫生设施的恩泽、疫苗的应用和抗生素的发现所引领的20世纪上半叶到

中叶的革命，使科学界大胆地夸耀着翻过了传染病这页,相信它们基本

上〃被征服〃了。然而，不久之后就变得清楚，这样的说法过于乐观，原因

包括新传染病（包括艾滋病）的出现和抗微生物耐药性的崛起等发展c随

着对人类基因组、社会和经济力量的更深入了解，致病潜力不再仅归因于

微生物。相反，传染病被重新定义为微生物与宿主在社会和环境背景下的

相互作用过程的交;匚点。

更重要的是，我们认识到微生物群落（菌群），存在于所有的宏观生物，

包括植物和动物身上，为发育、生理、繁殖和御感染提供了必不可少的

功能。这使得微生物与人类之间的关系从对抗转变为更加微妙的互动。我

们体内的所谓共生菌在某些情况下可以保护我们免受病原体侵害，但也可

能成为病原体；这种二元性在1962年被西奥多•罗斯伯里称为〃两栖共生〃。

这种界限的模糊并没有意味着控制感染的努力的终结。然而，随着保持抗

生素使用的压力，包括开发新的抗菌药物以克服抗药性、大规模消灭运动

和广泛的预防措施，人们开始转向益生菌，包括益生元和益生菌干预、粪

便移植、肠道修复和回归自然等方法。

这种对抗生素和益生菌的双重姿态所导致的紧张局势，在20世纪全球人

类寿命延长的过程中不断升级。然而，有证据表明，寿命正在趋于平稳,

甚至在某些地区有所下降。部分原因是现代社会面临肥胖、糖尿病、过敏

和自身免疫性疾病、药物过量、暴力死亡和某些癌症等问题。这些变化发

生在历史背景下，各个国家之间和内部健康状况存在明显差异的情况下，

与几十年前相比，全球城市化趋势和食物、污染物、微生物接触方式也发

生了显著变化。

人类与我们居住的微生物之间的动态反映出了一种丰富和缺失的悖论情

况。一方面，许多新发传染病的出现以及耐药性细（所谓的〃超级细〃）

的崛起