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46卷4期国预防兽医学报Vol.46,No.4
2024年4月ChineseJournalofPreventiveVeterinaryMedicineApr.2024
doi10.3969/j.issn.1008-0589.202308006
中国新疆吐鲁番地区小亚璃眼蜱遗传进化及单倍型分析
覮覮,周金普,甘*
温丽翠,才善,石文玉娜,敏,浩,赵珊珊露,巴音查汗
(新疆农业大学动物医学学院,新疆乌鲁木齐830052)
摘要:为探究中国新疆吐鲁番艾丁湖镇(后简称吐鲁番地区)小亚璃眼蜱的遗传进化特征及单倍型,本研究
提取10份来自中国吐鲁番地区已经形态学鉴定为小亚璃眼蜱的DNA作为模板,采用本研究室设计的中国新疆地
区优势璃眼蜱种16SrRNA基因通用引物,通过PCR进一步鉴定上述小亚璃眼蜱并测序;采用DNAMANV5.0软件
分吐鲁番地区10份小亚璃眼蜱16SrRNA基因与来自中国新疆(阿瓦提)、巴基斯坦、印度小亚璃眼蜱相应基因的
同源性;经MEGAX软件构建小亚璃眼蜱与上述地区来源的小亚璃眼蜱16SrRNA基因的系统发育树,分析小亚
,,经
眼蜱种的亲缘性和遗传多样性。PCR结果显示10份小亚璃眼蜱均扩增出388bp的目的基因片段BLAST比对
;,本研究采集的
结果显示10份样品均为小亚璃眼蜱16SrRNA基因序列的同源性分结果显示10份小亚璃眼蜱
之间的同源性最高,达99.57%,与来自巴基斯坦、印度、中国新疆(阿瓦提株MG651939)小亚璃眼蜱的同源性分
别为99.55%、99.17%及99.11%;16SrRNA基因的遗传进化分结果显示,中国新疆吐鲁番的小亚璃眼蜱1、3、9
,小,遗
及10聚为一小支遗传距离较近;亚璃眼蜱2、48与巴基斯坦、印度及中国新疆小亚璃眼蜱聚为一大支
提,。采用
传距离较近。示中国吐鲁番地区的小亚璃眼蜱可能来自巴基斯坦DNASPV5.0软件统计吐鲁番及上述
国家或地区小亚璃眼蜱的单倍型数量(Np)、单倍型多样性(Hd)及核甘酸多样性(pi);采用Popartv1.7软件构建吐鲁
。,来自
番及上述国家或地区小亚璃眼蜱的单倍型网络图结果显示4个不同国家或地区小亚璃眼蜱的Np为8,分
别为Hap_1Hap_8,Hd为0.572、pi为0.01156。与其他3个地区相比,中国吐鲁番地区小亚璃眼蜱的Np最高为7、
Hd为0.911、pi为0.02593。小亚璃眼蜱单倍型网络图显示,在4个国家或地区小亚璃眼蜱仅共享单倍型Hap_1,其
他3个地区存在单倍型Hap_2Hap_8。中国吐鲁番地区小亚璃眼蜱不仅共享单倍型Hap_1,还存在单倍型Hap_3
Hap_8。上述结果表明吐鲁番地区小亚璃眼蜱可能来源于中国新疆阿瓦提地区及巴基斯坦,且其遗传多样性较为
丰富。本研究为了解蜱种群间的种属鉴定和遗传进化关系等提供参考依据。
关键词:小亚璃眼蜱;遗传进化;单倍型
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