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(一)操作步骤:
1.将胶板放在胶槽中,保持水平。
2.称取0.12g(8%)琼脂糖至锥形瓶中,加入15mlTAE,微波炉加热至全部溶解。
3.等凝胶温度降至50-60℃,加入溴化乙锭(1mg/l)至终浓度0.5μg/ml,摇匀后快速倒入
胶板中,除去气泡梳子。
4.待胶凝固后(室温30-45min,至少20min)轻轻拔出梳子,将胶放入电泳槽中,添补电
泳缓冲液TAE至大约高出凝胶1mm。
5,将电泳样品与6×loadingbuffer适量混合点入连接好电极,选择适当电压(不大
于5V/cm)开始电泳。
6.根据溴酚蓝位置适时停止电泳,紫外光下观察。
(二)注意事项:
1.EB是一种强诱变剂(可能造成遗传性危害),直接接触有中等毒性。EB可以通过皮肤吸
收,因此应当避免一切与EB的直接接触。EB对皮肤,眼睛,口腔和上呼吸道系统有刺激
性作用。应将EB安全密封,并密闭存放于干燥避光处。
如果EB不慎落入眼睛,立即用大量的冷水冲洗至少15分钟。能用洗眼进行擦洗;
如果皮肤不慎接触到EB,立即脱去被污染的衣物。再用肥皂接触到的皮肤后,大量的
冷水冲洗至少15分钟。
2.融胶时随着融化次数的增加,水分丢失也越多,凝胶浓度则会越来越高,导致实验结果
不稳定,可适量添加缓冲液的量。
(三)实验原理及遇到问题:
1.原理:使用琼脂糖凝胶作为电泳支持介质,发挥分子筛功能,使得大小和构象不同的核
酸分子的迁移率出现较大差异,分子的迁移速度与其相对分子量成反比,从而达到分离
的目的。分子在高于其等电点的溶液中带负电,在电场中向阳极移动。
2.琼脂糖凝胶电泳时加样侧应位于负.
3.EB的作用:溴化乙锭是一种荧光,它可以嵌入分子中并在紫外照射下发出橙
红色荧光,这种与分子的结合几乎没有碱基序列的特异性。
4.琼脂糖浓度与(线状)分离范围:0.9%的凝胶可分离0.5-7kb的分子;1.2%
的凝胶可分离0.4-6kb的分子;1.5%的凝胶可分离0.2-3kb的分子
5.当电压增大时琼脂糖凝胶分离的有效范围反而缩小,所以根据实验需要也可作适当调整
(1)Operationsteps:
1.cetheglueboardinthegluetankandkeepitlevel.2.Weigh0.12g(8%)agaroseintoanErlenmeyerflask,add
15mlTAE,andheatinthemicrowaveuntilcompletelydissolved.3.Waitforthegeltemperaturetodropto50-60°C,
addethidiumbromide(1mg/l)toafinalconcentrationof0.5μg/ml,shakewellandquicklypouritintothegelte,
removeairbubbandinsertacomb.4.Afterthegelsolidifies(30-45minutesatroomtemperature,atleast20
minutes),gentlypulloutthecomb,putthegelintotheelectrophoresistank,andaddelectrophoresisbufferTAEto
about1mmabovethegel.5.Mixanappropriateamountoftheelectrophoresissampleand6×loadingbuffer
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