2025年大学《生物信息学》专业题库—— 生物信息学对种群遗传结构的分析.docxVIP

2025年大学《生物信息学》专业题库——生物信息学对种群遗传结构的分析

考试时间：______分钟总分：______分姓名：______

一、选择题（每题2分，共20分）

1.在种群遗传结构分析中，下列哪种分子标记通常具有多态性高、丰度高、遗传稳定性好等特点？

A.mitochondrialDNA

B.chloroplastDNA

C.microsatellites

D.Simplesequencerepeats(SSRs)

2.用于衡量种群间遗传分化程度的统计量Fst，其值范围通常在？

A.0到1之间

B.-1到1之间

C.0到无穷大之间

D.-1到无穷大之间

3.Structure软件进行群体结构分析时，需要预先设定的一个关键参数是？

A.群体数量（K值）

B.样本大小

C.遗传距离

D.分子标记类型

4.在进行基因型数据质量控制时，通常会过滤掉哪些类型的个体数据？

A.Hardy-Weinberg平衡偏离严重的个体

B.基因型频率不符合孟德尔遗传定律的个体

C.缺失数据比例过高的个体

D.以上所有

5.PrincipalComponentAnalysis(PCA)在种群遗传结构分析中主要用途是？

A.确定种群数量K值

B.估计个体间遗传距离

C.探索样本在多个维度上的主要变异模式

D.检测群体间的遗传分化程度

6.ADMIXTURE软件主要用于分析？

A.种群个体间的遗传距离

B.种群内部的遗传结构

C.个体基因型频率的分布

D.基因流在种群历史中的影响

7.AMOVA（AnalysisofMolecularVariance）分析中，组分变异（ComponentofVariation,CV）通常表示为？

A.总变异

B.群体内变异（Within-populationvariance）

C.群体间变异（Between-populationvariance）

D.系统发育变异

8.产生VCF（VariantCallFormat）文件的主要目的是？

A.存储个体的基因型数据

B.存储个体的序列质量值

C.存储参考基因组序列

D.存储样本信息

9.以下哪个软件主要用于进行基因型数据的质量控制、格式转换和基本统计？

A.Structure

B.ADMIXTURE

C.PLINK

D.DAPLD

10.在解读邦戈-芒德尔图（邦戈图）时，通常用于评估群体间Fst值显著性差异的统计检验方法是？

A.Chi-squaretest

B.Fishersexacttest

C.Permutationtest

D.t-test

二、填空题（每空1分，共15分）

1.常用的分子标记类型包括简单序列重复（__________）、单核苷酸多态性（__________）、线粒体DNA等。

2.衡量基因型数据缺失率的常用指标是缺失率（__________）。

3.用于检验群体基因型数据是否符合Hardy-Weinberg平衡的统计量是__________。

4.在Structure分析中，通过观察不同K值下的个体聚类结果，并结合ΔK值等方法来确定最优的群体数量__________。

5.PCA分析产生的主成分（PrincipalComponents,PCs）是原始变量线性组合构成的新变量，其解释了样本数据变异性的__________。

6.Fst统计量值越大，通常表示种群间的__________程度越高。

7.AMOVA分析中，总变异被分解为群体内变异（__________）、群体间变异（__________）和误差变异三部分。

8.在生物信息学流程中，从原始测序数据生成基因型数据通常需要经过__________、变异检测和基因型Calling等步骤。

9.估计种群历史参数（如有效种群大小、迁徙率）的软件工具包括__________和ms等。

10.解释种群遗传结构分析结果时，需要结合__________和地理分布等信息。

三、简答题（每题5分，共20分）

1.简述在进行种群遗传结构分析前，对基因型数据进行质量控制的必要性及主要包含的内容。

2.简述Fst统计量的计算原理及其在种群遗传结构分析中的主要用途。