2025年大学《生物信息学》专业题库—— 长链非编码RNA与癌症的生物信息学分析.docxVIP

2025年大学《生物信息学》专业题库——长链非编码RNA与癌症的生物信息学分析

考试时间：______分钟总分：______分姓名：______

一、选择题（每题2分，共20分）

1.下列哪一项不是长链非编码RNA（lncRNA）的典型特征？

A.分子量通常大于200nt

B.在大多数物种中转录本丰度较高

C.通常不具备蛋白质编码能力

D.主要在细胞核内发挥作用

2.在进行RNA-Seq数据分析以鉴定差异表达lncRNA时，哪个步骤通常被认为是去除宿主基因（主要是rRNA和tRNA）表达影响的关键环节？

A.转录本组装

B.基因表达量定量

C.质量控制（QC）

D.使用专门的宿主RNA过滤工具或策略

3.常用的lncRNA功能注释数据库NONCODE主要收录了哪些类型的信息？

A.仅lncRNA的基因序列和位置

B.仅已知的lncRNA与蛋白质的结合信息

C.来自多个物种的lncRNA转录本序列、结构注释、已知功能注释及相关文献

D.仅lncRNA的保守基序信息

4.GO富集分析主要用来做什么？

A.预测lncRNA可能调控的靶基因

B.确定差异表达lncRNA或其靶基因主要参与的生物学过程、分子功能或细胞定位

C.计算lncRNA的表达水平变化幅度

D.构建lncRNA之间的相互作用网络

5.以下哪个数据库最常被用于存储和检索TCGA（TheCancerGenomeAtlas）项目产生的癌症基因组数据？

A.GEO(GeneExpressionOmnibus)

B.Lncipedia

C.TCGADataPortal

D.ENCODE

6.在构建lncRNA-miRNA-mRNA调控网络时，RBP-Seq（RNA-BindingProtein-Seq）数据主要提供了哪方面的信息？

A.lncRNA与miRNA的结合证据

B.miRNA与mRNA的结合证据

C.lncRNA与mRNA的直接相互作用证据

D.RNA聚合酶在转录起始位点的结合信息

7.评估一个分类模型（如预测lncRNA致癌性的模型）性能的指标AUC（AreaUndertheROCCurve）主要反映了什么？

A.模型的总体预测精度

B.模型区分正负样本的能力（区分度）

C.模型预测结果的平均绝对误差

D.模型预测值与真实值之间的相关系数

8.lncRNA的ceRNA（CompetingEndogenousRNA）假说认为lncRNA通过什么机制影响其靶mRNA的表达？

A.直接调控靶基因的启动子区域

B.与miRNA结合，从而阻止miRNA结合到其靶mRNA上

C.与RNA聚合酶直接相互作用，抑制转录过程

D.通过表观遗传修饰沉默靶基因

9.以下哪项技术通常不用于直接检测lncRNA与蛋白质的相互作用？

A.RIP-seq(RNAImmunoprecipitationsequencing)

B.CLIP-seq(CrosslinkingImmunoprecipitationsequencing)

C.RNA-Seq

D.Co-IP-seq(ChromatinImmunoprecipitationsequencingwithantibodyagainstRNA-bindingprotein)

10.对于研究lncRNA在癌症中的诊断或预后价值，以下哪种分析策略较为常用？

A.鉴定肿瘤组织与正常组织中差异表达的lncRNA

B.构建包含多个lncRNA表达信息的特征向量，并利用机器学习模型进行分类或回归分析

C.仅进行lncRNA的序列保守性分析

D.鉴定与癌症发生直接相关的lncRNA编码的蛋白质

二、填空题（每空1分，共15分）

1.长链非编码RNA（lncRNA）是一类长度通常大于__200__核苷酸，且主要不具备蛋白质编码能力的RNA分子。

2.在进行RNA-Seq数据分析时，常用的__FastQC__工具用于初步评估原始测序数据的质量。

3.__GENCODE__是一个整合了多种来源注释信息的、广泛使用的参考基因组注释数据库，其中包含了lncRNA的注释。

4.为了减少宿主RNA（如rRNA）对RNA-Seq数据的干扰，分析前通常需