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大白菜卷叶和矮小突变体dcl1的基因定位与转录组解析：探索生长发育调控机制

一、引言

1.1研究背景与意义

大白菜（Brassicarapassp.pekinensis）作为十字花科芸薹属中最重要的蔬菜作物之一，在我国蔬菜产业里占据着举足轻重的地位。它是我国特产蔬菜，拥有悠久的栽培历史，全国各地均有广泛种植，即便是在海拔3600m的西藏拉萨等高原地区也不例外，不过主要产区集中在长江以北。据农业部统计数据显示，2006年全国蔬菜种植面积达1821.69万公顷，其中大白菜播种面积为262.37万公顷，占蔬菜种植面积的14.4%，年总产量超过1亿吨，占全国蔬菜总产量的18%。大白菜生态类型丰富多样，具有产量高、耐贮运、供应期长、营养丰富、食用方法多样等优势，并且种植相对容易，省工、成本低，深受广大消费者和种植户的喜爱。随着育种研究的不断深入，大白菜系列配套优良新品种相继育成并逐步完善，栽培技术也持续进步，春、夏季大白菜生产发展态势迅猛，基本上实现了大白菜的周年供应。在我国北方广大地区，秋、冬季大白菜的生产与供应依然占据主导地位。进入21世纪以来，在全国不同地区逐步形成了一批专业化、规模化的生产基地，为我国大白菜市场的均衡供应和出口创汇发挥着越来越重要的作用。

植物突变体是研究植物基因功能和生长发育机制的重要材料。通过对突变体的研究，可以深入了解基因的功能、调控网络以及它们在植物生长发育过程中的作用。在大白菜研究中，突变体同样具有重要价值。突变体能够为我们揭示大白菜生长发育的遗传机制提供独特的视角，帮助我们找到与重要农艺性状相关的基因，从而为大白菜的遗传改良和新品种培育提供理论基础和技术支持。例如，通过对叶形突变体的研究，可以深入了解叶片发育的分子机制，为培育具有理想叶形的大白菜品种提供依据；对矮化突变体的研究，有助于揭示植物株高调控的遗传网络，为选育矮化、抗倒伏的大白菜品种奠定基础。

dcl1突变体作为一种具有卷叶和矮小表型的大白菜突变体，其独特的性状表现为我们研究大白菜的生长发育机制提供了一个难得的切入点。卷叶和矮小性状不仅影响大白菜的外观形态，还可能与光合作用、物质运输、抗逆性等生理过程密切相关。通过对dcl1突变体的深入研究，有望揭示这些性状形成的分子机制，挖掘与之相关的关键基因，进一步丰富我们对大白菜生长发育遗传调控的认识。这不仅有助于我们深入理解植物生长发育的基本规律，还能为大白菜的遗传育种提供新的基因资源和理论指导，具有重要的理论和实践意义。

1.2大白菜突变体研究现状

近年来，大白菜突变体库的构建取得了显著进展。科研人员利用不同浓度甲基磺酸乙酯（EMS）诱变大白菜自交系种子，根据M1代植株发芽率、成活率、育性及M2代成活率，筛选出适宜的EMS诱变浓度，通过EMS种子诱变1次、EMS种子诱变2次及EMS花蕾诱变结合小孢子培养的方法，成功构建了含有多个家系及相应自交M2代种子的大白菜突变体库。在这些突变体库中，科研人员对M2群体苗期和莲座期的叶片性状进行了形态学调查，发现总的表型变异频率较高。

在各类大白菜突变体表型研究方面，也取得了丰富的成果。例如，在叶形突变体研究中，沈阳农业大学从EMS诱变群体中获得了一个卷叶突变体cl1，并将其命名为Brcl1YS，测序验证确定了Brc11YS的候选区间位于A02染色体上的97.5kb区域，序列差异和共分离验证证实，BraA02g017030.3C是Brc11YS位点最有可能的候选基因。在矮化突变体研究中，有研究以白菜矮化突变体cd1为材料，利用BSR-Seq分析与验证最终将矮化突变体cd1基因初步定位在引物L06-09与L06-14之间（物理位置-，并确定了三个候选基因。此外，还有早抽薹突变体、抗根肿病突变体等方面的研究也不断有新的突破。

然而，对于大白菜卷叶和矮小突变体的研究，目前仍存在一些不足之处。虽然已经鉴定出一些相关突变体并进行了初步的基因定位，但对于这些突变体性状形成的分子机制，尤其是涉及到的基因调控网络和信号传导途径，还缺乏深入系统的研究。此外，不同研究之间的结果整合和比较也相对较少，这限制了我们对大白菜卷叶和矮小性状遗传调控机制的全面理解。因此，进一步深入研究大白菜卷叶和矮小突变体，对于完善我们对大白菜生长发育遗传机制的认识具有重要意义。

1.3基因定位与转录组分析技术在植物研究中的应用

基因定位是指确定基因在染色体上的位置和排列顺序的过程。在植物研究中，常用的基因定位方法包括图位克隆、关联分析、全基因组重测序等。这些方法在植物基因挖掘和功能研究中发挥着关键作用。通过基因定位，可以将与重要农艺性状相关