第三章序列分析.ppt

序列组成/分子量/等电点---初级分析酶切位点分析(载体构建)基因结构分析/启动子序列分析序列功能分析的内容第61页，共92页，星期日，2025年，2月5日Part1.初级序列分析序列的组成/分子量/等电点分析第62页，共92页，星期日，2025年，2月5日/第63页，共92页，星期日，2025年，2月5日第64页，共92页，星期日，2025年，2月5日Part2.

酶切位点分析只要进行基因工程利用必须用到各种限制性内切酶如GGATCCBamHI第65页，共92页，星期日，2025年，2月5日Blastn---1第29页，共92页，星期日，2025年，2月5日Blastn---1第30页，共92页，星期日，2025年，2月5日Blastn---1Blastn1的作用：①对于已知的基因，可以分析其相似基因；②对于未知的基因片段，可以分析其属于什么基因。第31页，共92页，星期日，2025年，2月5日Blastn---1第32页，共92页，星期日，2025年，2月5日Blastn---1第33页，共92页，星期日，2025年，2月5日Blastn---2WhatisEST?第34页，共92页，星期日，2025年，2月5日Blastn---2第35页，共92页，星期日，2025年，2月5日Blastn---2有什么作用?对于新基因，可以了解基因的结构特征,5-UTR和3-UTR的大小.第36页，共92页，星期日，2025年，2月5日Blastp第37页，共92页，星期日，2025年，2月5日Blastp第38页，共92页，星期日，2025年，2月5日Blastp第39页，共92页，星期日，2025年，2月5日Blastp第40页，共92页，星期日，2025年，2月5日Blastp第41页，共92页，星期日，2025年，2月5日Blastp第42页，共92页，星期日，2025年，2月5日BlastpBlastp的作用：①对于已知的蛋白，可以分析其相似蛋白；②对于未知的蛋白片段，可以分析其属于什么蛋白。第43页，共92页，星期日，2025年，2月5日具体步骤1.登陆blast主页/BLAST/2.根据数据类型，选择合适的程序3.填写表单信息4.提交任务5.查看和分析结果第44页，共92页，星期日，2025年，2月5日第45页，共92页，星期日，2025年，2月5日rice第46页，共92页，星期日，2025年，2月5日第47页，共92页，星期日，2025年，2月5日第48页，共92页，星期日，2025年，2月5日第49页，共92页，星期日，2025年，2月5日Blastx第50页，共92页，星期日，2025年，2月5日Blastx第51页，共92页，星期日，2025年，2月5日Blastx第52页，共92页，星期日，2025年，2月5日BlastxBlastx:分析你的基因编码什么产物?分析你的基因是否是新基因？第53页，共92页，星期日，2025年，2月5日Blastx第54页，共92页，星期日，2025年，2月5日tBlastn第55页，共92页，星期日，2025年，2月5日tBlastn第56页，共92页，星期日，2025年，2月5日tBlastntBLASTn的作用:已知一种蛋白序列，在另一物种中进行其同源蛋白基因的电子克隆(insilicocloning)；寻找一个新的蛋白质序列(如双向电泳得到的)是否已有核酸序列，是否可以克隆？第57页，共92页，星期日，2025年，2月5日Blastx当Blastx没有结果时，可以考虑使用。第58页，共92页，星期日，2025年，2月5日第一节序列比对第二节Blast应用第三节序列功能分析第59页，共92页，星期日，2025年，2月5日序列分析的目的是什么?--为了功能的分析--拿到一个基因/蛋白质序列,我能做什么?第60页，共92页，星期日，2025年，2月5日*第1页，共92页，星期日，2025年，2月5日什么是序列分析?拿到一个基因/蛋白质序列,我能做什么?第2页，共92页，星期日，2025年，2月5日在数据库中进行序列相似性搜索基因结构分析/启动子序列分析Motif的寻找与序列的模式识别(含亚细胞定位,跨膜