蛋白质工程复习.pdfVIP

蛋白质工程复习

（个人整理，答案粗略，仅供参考）

第一章蛋白质结构基础

肽键：一个氨基酸的α-NH2与另一个氨基酸的α-COOH脱水缩

合而形成的酰胺键叫肽键。多肽链：通过肽键将多个氨基酸连接在一

起构成多肽链。

蛋白质的一级结构：就是蛋白质多肽链中氨基酸残基的排列顺序，

也是蛋白质最基本的结构，是由氨基酸上遗传密码的排列顺序所决定

的。

蛋白质的二级结构：指肽链的主链在空间的排列,或规则的几何走

向、旋转及折叠。它只涉及肽链主链的构象及链内或链间形成的氢键。

附：α-β-β-转角、无规卷曲。

α-螺旋是蛋白质中最常见，最典型、含量最丰富的二级结构元件。

β—折叠也称β—结构或β—构象，它是蛋白质中第二种最常见的

二级结构。

回折：回折结构就是使所连接的肽链发生180@的反向弯曲。

超二级结构：相邻的二级结构单元组合在一起，彼此相互作用，

形成规则排列的组合体，以同一结构模式出现在不同的蛋白质中，这

些组合体称为超二级结构。（超二级结构的基本类型：αα、βαβ、ββ）

三级结构：蛋白质的多肽链在各种二级结构的基础上进一步盘曲

或折叠形成具有一定规律的三维空间结构，称为蛋白质的三级结构。

四级结构：由两条或两条以上具有独立三级结构的多肽链组成的

蛋白质就是寡聚蛋白，分子中多肽链间通过次级键相互组合而形成的

空间结构称为四级结构。

结构域：是指二级结构和结构模体以特定的方式组织连接，在蛋

白质分子中形成两个或多个在空间上可以明显区分的三级折叠实体。

亚基：通常亚基只有一条多肽链，但有的亚基由两条或多条多肽

链组成，这些多肽链间多以二硫键相连。亚基单独存在时无生物学活

性。

蛋白质变性：指天然蛋白质分子中的次级键被破坏，引起天然构

象解体，形成无规则卷曲的构象。

蛋白质复性：指当变性因素除去后，变性蛋白又可以重新恢复到

天然构象，这一现象称为蛋白质的复性。

蛋白质的折叠：蛋白质可凭借相互作用在细胞环境(特定的酸碱度、

温度等)下自己组装自己，这种自我组装的过程被称为蛋白质折叠。

分子伴侣：即是一类相互之间有关系的蛋白，它们的功能是帮助

其他含多肽结构的物质在体内进行正确的非共价键的组装，并且不是

组装完成的结构在发挥其正常的生物功能时的组成部分。其可介导蛋

白质的正确的折叠与装配，但并不构成被介导的蛋白质组分。

分子伴侣的作用：1、帮助新翻译的蛋白的折叠2帮助蛋白质的跨

膜转运3、使一些聚合蛋白解聚4、催化不稳定蛋白的降解5、控制具

有生物活性的调节蛋白的折叠，包括转录因子从而调节基因的转录6、

参与细胞内囊泡的转运7、参与细胞骨架蛋白的装配从而影响细胞的

发育。

第二章蛋白质分子设计

1、蛋白质分子设计的基本内容：就是为有目的的蛋白质工程改造

提供设计方案。蛋白质分子设计属于交叉领域，涉及多个学科。其设

计过程主要依赖于蛋白质结构的测定和分子模型的建立，按照蛋白质

结构功能的关系，综合运用生物信息学、计算生物学、计算机技术、

基因工程学等多学科的技术手段，确保获得比天然蛋白质性能更优越

的新型蛋白质。

2、蛋白质分子设计原理：

答案一(课件)

内核假设蛋白质的独特的折叠形式是由蛋白质内核中残基的相互

作用决定。（内部十分保守的区域）

Pr内部都是密堆积（很少有空穴大到水分子可以结合一个水分子

或惰性气体），没有重叠

所有内部的氢键都是最大满足的（主链和侧链）。蛋白质的氢键

形成涉及一个交换反应，溶剂键被蛋白质键所取代

疏水及亲水基团需要合理的分布在溶剂可及表面及不可及表面。

分布代表疏水效应的主要驱动力

金属Pr中配位残基的替换要满足金属配位几何。要求围绕金属中

心放置合适数目的蛋白质侧链或溶剂分子，并符合正确的键长、键角

以及整体的几何。

对于金属Pr，围绕金属中心的第二壳层中的相互作用是重要的。

氢键的第二壳层通常涉及与蛋白质主链的相互作用。

最优的aa侧链几何排列。Pr侧链构象由空间两个立体因素所决定

(一是立体势垒，二是aa的位置)

结构及功能的专一性。这是Pr