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肠道菌群功能变迁的代谢网络扰动机制研究
目录
肠道菌群功能变迁的代谢网络扰动机制研究（1）．．．．．．．．．．．．．．．．3
一、内容概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3
1.1肠道菌群的重要性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
1.2代谢网络的基本概念．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5
1.3研究目的与核心问题．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8
二、研究背景与文献综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9
2.1肠道菌群的分类与功能．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11
2.2代谢网络的基本特征及其与宿主健康的关联．．．．．．．．．．．．．．．．13
2.3肠道菌群功能变迁的主要原因与机制探析．．．．．．．．．．．．．．．．．．15
三、研究方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17
3.1数据收集与处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19
3.2分析工具与算法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22
3.3研究模型的构建与验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25
四、肠道菌群功能变迁与代谢网络扰动的理论框架．．．．．．．．．．．．．27
4.1代谢网络模型的构建过程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29
4.2功能扰动理论解析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30
4.3各种因素对代谢网络扰动的影响评估．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34
五、实验结果与数据分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35
5.1不同阶段肠道菌群代谢网络的构建与比较．．．．．．．．．．．．．．．．．．36
5.2异常菌群与代谢网络的扰动分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39
5.3不同扰动机制对宿主健康影响的模拟实验．．．．．．．．．．．．．．．．．．40
六、讨论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．44
6.1研究结果的临床意义与应用前景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．45
6.2本研究中发现的新机制及其可能带来的科学挑战．．．．．．．．．．．．46
6.3未来研究方向展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．51
七、总结．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．52
7.1主要研究结论及创新之点．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．56
7.2研究的局限性和未来改进方向．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．57
肠道菌群功能变迁的代谢网络扰动机制研究（2）．．．．．．．．．．．．．．．60
内容简述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．60
1.1肠道菌群的重要性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．61
1.2代谢网络扰动与肠道菌群功能变迁的关系．．．．．．．．．．．．．．．．．．63
肠道菌群与代谢网络的基本概念．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．65
2.1肠道菌群．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．65
2.2代谢网络．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．68
2.3肠道菌群与代谢网络之间的相互作用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．70
肠道菌群功能变迁的代谢网络扰动机制研究方法．．．．．．．．．．．．．73
3.1相关研究方法概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．75
3.2数据收集与预处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．76
3.3基于代谢组学的分析方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．78
3.4生物信息学分析方法．．．．
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