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第61页,共93页,星期日,2025年,2月5日多色FISH图第62页,共93页,星期日,2025年,2月5日第63页,共93页,星期日,2025年,2月5日第64页,共93页,星期日,2025年,2月5日由于FISH具有安全、经济、灵敏快速和精确等优点,它已被广泛运用于:9.基因诊断、产前诊断及肿瘤病理学等领域……1.基因定位2.染色体的同源性、染色体起源与进化的研究3.染色体与基因突变的研究4.异常染色体及染色体病检测5.外源染色体的鉴定6.转基因动植物外源基因整合位点的检测7.比较基因组结构和功能8.DNA分子及基因物理图谱的构建第65页,共93页,星期日,2025年,2月5日(六)FISH技术应用实例第66页,共93页,星期日,2025年,2月5日杨征等(2000):以人的ras基因为探针,运用荧光原位杂交技术,首次对ras基因在玉米中同源序列进行了定位。结果表明:ras探针在第2号和第7号染色体上均检出了杂交信号。A.在第2和第7号染色体长臂同时检出ras探针杂交信号;B.在2条第7号染色体长臂同时检出ras探针杂交信号;Ras基因:促进细胞增殖,抑制细胞凋亡的原癌基因第67页,共93页,星期日,2025年,2月5日C.ras探针杂交信号在第7号染色体长臂上;D.ras探针杂交信号在第2号染色体长臂上;第68页,共93页,星期日,2025年,2月5日Northern印迹杂交是指将待测RNA样品经电泳分离后转移到固相支持物上,然后与标记的核酸探针进行固—液相杂交,以检测RNA(主要是mRNA)的方法。其基本原理和基本过程与Southern印迹杂交基本相同。只是在以下几点有所不同。(二)Northern印迹杂交1.靶核酸——RNA2.RNA电泳——在变性胶中进行(加入变性剂,以维持单链线性状态)3.转膜——电泳后不需要再进行变性和中和,直接用毛细管虹吸法等方法转移。第29页,共93页,星期日,2025年,2月5日(三)斑点及狭缝印迹杂交特点:简单、快速,可在同一张膜上同时进行多个样品的检测;但不能鉴别分子量,且特异性不高,有一定比例的假阳性。将RNA或DNA变性后直接点样于硝酸纤维膜和尼龙膜上,用于基因组中特定基因及其表达的定性及定量研究,称为斑点印迹(dotblot)。如印迹是线状则为狭缝印迹或狭线印迹(slotblot)第30页,共93页,星期日,2025年,2月5日(四)原位杂交核酸保持在细胞或组织样本中,经适当的方法处理细胞或组织后,将标记的核酸探针与细胞或组织中的核酸进行杂交,称为原位杂交(insituhybridization)。这是一种标记DNA与整个染色体杂交并且发生杂交的区域可通过显微镜观察的技术。特点:(1)不受组织成分的影响;(2)灵敏度高;(3)可完整保持细胞或组织形态,准确反映组织细胞的相互关系及功能;(4)可检测多个探针。核酸原位杂交包括组织细胞的固定、预杂交、杂交、冲洗及信号检测等基本步骤。第31页,共93页,星期日,2025年,2月5日1.组织或细胞的固定2.组织细胞杂交前的预处理(预杂交)3.探针的选择和标记4.杂交5.杂交结果检测重点介绍荧光原位杂交(fluorescenceinsituhybridization,FISH)第32页,共93页,星期日,2025年,2月5日概念:液相杂交是指待测核酸分子与核酸探针都存在于杂交液中,碱基互补的单链核酸分子在液体中配对形成杂交分子。种类:A.RNA酶保护分析法(RNaseprotectionassay,RPA)用于mRNA定量、mRNA末端定位及确定内含子在相应基因中的位置等。(五)液相杂交1.制备待测RNA;2.RNA探针的标记3.杂交;4.除去单链RNA5.电泳分析第33页,共93页,星期日,2025年,2月5日B.核酸酶S1保护分析法(nucleaseS1protectionassay)用于基因转录起始位点分析及内含子剪切位点分析。其原理与RNA酶保护分析法类似.第34页,共93页,星期日,2025年,2月5日1.cDNA探针:逆转录→cDNA→克隆于载体→扩增重组质粒→提取质粒→消化重组质粒→切割cDNA片段→分离纯化→cDNA探针cDNA探针应用最广泛2.基因组DNA探针:从基因组文库→
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