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机器学习在AChE活性预测中的应用研究
目录
内容概览．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3
1.1研究背景及意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
1.1.1乙酰胆碱酯酶的应用场景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5
1.1.2乙酰胆碱酯酶活性评价的重要性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6
1.2国内外研究现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9
1.2.1传统乙酰胆碱酯酶活性测定方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10
1.2.2基于机器学习的分子性质预测进展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15
1.3研究目标与内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17
1.3.1本研究的期望达成的目标．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18
1.3.2论文主要的研究内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19
相关理论与技术概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22
2.1乙酰胆碱酯酶的生物学特性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25
2.1.1乙酰胆碱酯酶的结构与功能．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28
2.1.2乙酰胆碱酯酶的催化机制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31
2.2机器学习的基本原理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32
2.2.1机器学习概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34
2.2.2常用机器学习算法介绍．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36
2.3分子性质计算．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39
2.3.1分子描述符的表示方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．41
2.3.2分子性质的量化计算．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43
数据集构建与预处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．45
3.1数据来源与收集．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．47
3.1.1数据来源途径．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．49
3.1.2数据集规模与样本构成．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．51
3.2数据预处理方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．52
3.2.1数据清洗．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．54
3.2.2数据标准化．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．55
3.2.3特征选择．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．57
基于机器学习的AChE活性预测模型构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．61
4.1预测模型选取．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．62
4.1.1不同机器学习算法的适用性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．66
4.1.2模型选择依据．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．68
4.2模型构建过程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．69
4.2.1模型训练与参数优化．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．71
4.2.2模型验证与评估．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．73
模型结果分析与讨论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．75
5.1模型预测性能评估．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．76
5.1.1性能指标选择．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．78
5.1.2
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