Linux系统下计算软件使用教程.pdfVIP

*会进一个特定的目录下，学会建立，删除，移动，目录和文件，掌握vim文字处理程

序（可以理解成Windows下的文本文档（*.txt），但是功能更强，可以在里面编辑程序，

fortran或者C语言程序）建议参见网页里面的内容非常详尽还有很多

例子，看时建议抓住重点看

关于origin（用来画DOS图）和VESTA（用来显示几何结构和电子结构）都非常容易学，

会基本操作就可，遇到问题可以上网查查或与同学交流

在Linux系统下计算软件VASP的使用

一、建好5个输入文件（POSCAR,INCAR,POTCAR,KPOINTS,一个提交文件）

1，POSCAR

手动建立，viPOSCAR…..

还可以在MS的帮助下建立

2，INCAR

咱们组有公用的INCAR文件，进行不同的计算只需改其中的几个参数就可以

了

3，POTCAR

从cluster上的某个目录下面拷贝过来，放到要计算的目录里

如果要算多个元素的体系，使用命令

Eg:catPOTCAR-NiPOTCAR-PtPOTCAR

4,KPOINTS文件，从别处拷贝一个，修改里面的参数即可

5，提交文件都可以用现成的，在老节点上（node1~node21）使用lsf.sub

新节点上使用yzx8vasp(记不清了，用绿衬底标出)

二、在服务器上编译vasp，一般管理员或别的用户以及编译过了，本平台编译好的目录在

/public/home/zslu/my-soft/vasp.5.2或/public/baoer/vasp.5.2，编译使用的mpi可能不同。

将上面目录下的可执行文件vasp拷贝到用户工作目录下或者在作业提交里通过目

录找到可执行文件vasp。

三、提交任务

使用命令

qsublsf.sub或者qsubyzx8vasp

会自动产生例如的字样，这个8026表示的就是你提交的这个

任务的任务号码

四、查看任务

qstat–a或qstat-n

*会进一个特定的目录下，学会建立，删除，移动，目录和文件，掌握vim文字处理程

序（可以理解成Windows下的文本文档（*.txt），但是功能更强，可以在里面编辑程序，

fortran或者C语言程序）建议参见网页里面的内容非常详尽还有很多

例子，看时建议抓住重点看

关于origin（用来画DOS图）和VESTA（用来显示几何结构和电子结构）都非常容易学，

会基本操作就可，遇到问题可以上网查查或与同学交流

在Linux系统下计算软件VASP的使用

一、建好5个输入文件（POSCAR,INCAR,POTCAR,KPOINTS,一个提交文件）

1，POSCAR

手动建立，viPOSCAR…..

还可以在MS的帮助下建立

2，INCAR

咱们组有公用