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传染病动力学模型景介绍SIR仓室模型传染病动力学模型基本形式实证分析及总结CONTENT02

01背景介绍PARTONE

一、背景介绍04基于传染病传播流行的规律，采用不同理论研究方法，研究归类分析表明目前传染病模型的研究大体分以下三个方面：传染病模型以微分方程为基础构建模型应用统计学方法构建模型时-空交互构建模型SIR模型系统动力学模型……回归模型非线性增长曲线模型时间序列分析模型……时空传播模型小世界网络模型虚拟地理环境基于GIS基础构建模型……

SIR仓室模型05早在1911年，Ross应用确定性模型研究疟疾传播过程中的各种影响因素，建立了疟疾流行的最初模型，这是历史上第一次把数学模型应用于流行病学研究。1926年科马克（Kermack）与麦肯德里克（McKendrick）构造了著名的SIR仓室模型。继而，又在1932年提出SIS仓室模型，并在分析所建立模型的基础上，提出了区分疾病流行与否的“阈理论”，为传染病动力学的研究奠定了基础。McKendrick(1876-1943)Kermack(1898-1970)

06基本再生数R0基本再生数(TheBasicReproductionNumber，R0)表示疾病发病初期，在完全易感人群中一个典型的感染病例能感染的平均二代病例数。如果R0l，且易感人群有持续稳定的输入，则感染的病例数将成倍增长，流行将持续发生。如果R0l，则每个感染病例不能感染二代病例，流行将终止。

如何确定R0071、最简单的方法是在流行早期估计流行的倍增时间(doublingtime)，同时考虑流行发展早期的随机波动情况，最后拟合指数增长方程得到R0估计值。2、非参数方法——时间序列分析直接估计R0值，主要是基于发病率或估计的感染率来计算，均基于传代时间(generationtimes)的分布，感染率数据可通过对疾病追踪感染接触数据而进行补充。3、拟合传染病流行的传播动力学模型，模型所得的结果效果很好，但模型需要许多参数。4、通过绘制流行早期传播链确定模型中R0的估计值，然而，疾病早期原始数据很难准确掌握(尤其是新发传染病)，因此，可通过拟合流行发病时间序列曲线来估计R0值。

02SIR仓室模型PARTTWO

SIR仓室模型9所谓SIR仓室模型就是针对某类传染病将该地区的人群分成以下三类（即三个仓室）：易感者（susceptibles）类：其数量记为S(t)，表示t时刻未染病但有可能被该类疾病传染的人数；染病者（infectives）类：其数量记为I(t)，表示t时刻已被感染成病人而且具有传染力的人数；移出者（removed）类：其数量记为R(t)，表示t时刻已从染病者类移出的人数。

SIR仓室模型10设总人口为N(t)，则有N(t)=S(t)+I(t)+R(t).K-M的SIR模型是一个十分简单粗糙的模型，它的建立基于以下三个基本假设：（1）不考虑人口的出生、死亡、流动等种群动力因素。这意味着考虑一个封闭环境而且假定疾病随时间的变化要比出生、死亡随时间变化显著得多，从而后者可以忽略不记。这样，此环境的总人口数始终保持为一个常数，即N(t)=K，或S(t)+I(t)+R(t)=K（2）一个病人一旦与易感者接触就必然具有一定的传染力。这里假设t时刻单位时间内，一个病人能传染的易感者数目与此环境内易感者总数S(t)成正比，比例系数为β，从而在t时刻单位时间内被所有病人传染的人数为βS(t)I(t)。?

SIR仓室模型11在以上三个基本假设下，易感者从患病到移出的过程可用下述框图描述SIRβSI?对每一个仓室的人口变化率建立平衡方程式，便得到以下模型：???（1.1）

SIR仓室模型12将（1.1）中三个方程两端分别相加，得?从而S(t)+I(t)+R(t)=K（常数）由于（1.1）中前两个方程中不含R，故实际上我们只需先讨论前两个方程：????(1.2)存在。

SIR仓室模型13由（1.2）有：???图1(1.3)

SIR仓室模型14令则当R01时，疾病流行；当R01时，疾病不会流行，染病者数量I(t)将单调下降而趋向于零。R0=1是区分疾病流行与否的阈值。??(1.4)?

SIR仓室模型15设人群中通过接种免疫成功的比例为p(0≤p≤1)，则S0就变成了(1-p)S0,从而R0变小为?由（1.5）式可知，R0越大，为防止疾病流行所需接种的人口比例p就越高。?(1.5)??

SIR仓室模型16求解方程（1.3），它过初值（S0，I0）的解为?由于当t→+∞时，I(t)→0,S(t)→S∞,代入（1.6）式并注意到S0+I0=K,得??(1.6)(1.7)(1.8)??

SIR仓室模型17案例分析：1666年英格兰Sheffied附件