林木外生菌根 GST 基因家族系统发育与选择压力 PAML 代码试题库及答案.docVIP

林木外生菌根GST基因家族系统发育与选择压力PAML代码试题库及答案

一、单项选择题（每题2分，共10题）

1.PAML软件主要用于？

A.序列比对B.系统发育分析C.基因编辑

答案：B

2.GST基因家族属于？

A.蛋白家族B.糖类家族C.脂肪家族

答案：A

3.外生菌根对林木的作用不包括？

A.增强抗逆性B.抑制生长C.促进养分吸收

答案：B

4.系统发育树构建方法不包括？

A.邻接法B.最小二乘法C.回归法

答案：C

5.PAML中分析选择压力的模块是？

A.codemlB.basemlC.yn00

答案：A

6.外生菌根与林木是？

A.寄生关系B.共生关系C.竞争关系

答案：B

7.GST基因功能与什么有关？

A.光合作用B.解毒作用C.呼吸作用

答案：B

8.构建系统发育树前需对序列进行？

A.注释B.比对C.翻译

答案：B

9.PAML可处理的数据类型是？

A.氨基酸序列B.图像数据C.音频数据

答案：A

10.研究选择压力可了解基因的？

A.表达量B.进化历程C.定位

答案：B

二、多项选择题（每题2分，共10题）

1.外生菌根的特点有（）

A.菌丝包裹根尖B.形成哈蒂氏网C.深入细胞内

答案：AB

2.GST基因家族成员可能参与（）

A.抗氧化防御B.信号转导C.细胞壁合成

答案：AB

3.系统发育树的类型有（）

A.有根树B.无根树C.二叉树

答案：AB

4.PAML软件能进行的分析有（）

A.选择压力分析B.基因进化速率估计C.基因功能验证

答案：AB

5.影响外生菌根形成的因素有（）

A.土壤养分B.温度C.光照

答案：ABC

6.构建系统发育树常用软件有（）

A.MEGAB.PAMLC.Photoshop

答案：AB

7.GST基因结构包括（）

A.外显子B.内含子C.启动子

答案：ABC

8.选择压力分析方法有（）

A.基于密码子模型B.基于氨基酸模型C.基于碱基模型

答案：AC

9.外生菌根对土壤的作用有（）

A.改善结构B.增加肥力C.降低微生物活性

答案：AB

10.PAML中参数设置影响（）

A.分析结果B.序列质量C.软件运行速度

答案：AC

三、判断题（每题2分，共10题）

1.外生菌根会阻碍林木对水分的吸收。（×）

2.GST基因家族成员功能都相同。（×）

3.系统发育树构建不需要序列数据。（×）

4.PAML只能用于分析植物基因。（×）

5.选择压力为正说明基因在进化中受到限制。（×）

6.外生菌根可提高林木的抗病能力。（√）

7.GST基因只存在于林木中。（×）

8.有根树和无根树信息完全一样。（×）

9.PAML软件操作简单无需学习。（×）

10.研究选择压力对理解基因进化机制有重要意义。（√）

四、简答题（每题5分，共4题）

1.简述外生菌根对林木生长的促进作用。

答案：外生菌根菌丝可扩大根系吸收面积，促进林木对养分（如磷等）和水分的吸收，增强林木抗逆性（如抗旱、抗病等），从而促进林木生长。

2.说明GST基因家族在植物中的重要功能。

答案：GST基因家族参与植物解毒过程，可清除体内有害物质；还在抗氧化防御中发挥作用，保护细胞免受氧化损伤，维持细胞正常生理功能。

3.构建系统发育树的基本步骤。

答案：首先获取目标序列，然后进行序列比对，选择合适的建树方法（如邻接法等），设置相关参数，最后利用软件构建系统发育树并进行评估和分析。

4.简述PAML软件在基因进化研究中的用途。

答案：PAML可用于分析基因的选择压力，判断基因在进化中受正选择、负选择还是中性选择；还能估计基因进化速率，了解基因进化历程。

五、讨论题（每题5分，共4题）

1.讨论外生菌根与林木共生关系在生态系统中的意义。

答案：外生菌根与林木共生，促进林木生长，增加森林生产力。改善土壤结构和肥力，影响土壤微生物群落。增强生态系统稳定性，提高其对环境变化的抵抗力，在物质循环和能量流动中发挥重要作用。

2.探讨GST基因家族系统发育研究对林木育种的潜在价值。

答案：通过研究GST基因家族系统发育，可了解基因进化关系，找到关键功能基因。有助于筛选具优良抗性等性状的林木品种，为林木育种提供理论依据，加速育种进程，培育优质品种。

3.分析