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第46卷2期宁夏医科大学学报
2024年2月JournalofNingxiaMedicalUniversity
2期窑137窑
文章编号:1674-6309(202源)园圆-0137-09
·论著·
胃癌中COL6基因家族的生物信息学分析
1,232,41,2
王彦凤,马磊,王宝祯,陈静
(1.宁夏医科大学基础医学院,银川750004;2.生育力保持教育部重点实验室,银川750004;
3.宁夏颐阳医院,银川750004;4.宁夏医科大学总医院,宁夏医科大学第一临床医学院,银川750004)
摘要:目的通过生物信息学方法系统性地分析COL6基因家族各成员在胃癌中的作用。方法利用
TIMER2.0和GEPIA2数据库分析COL6家族基因在胃癌组织中的表达与不同病理分期的关系。通过Kaplan-
MeierPlotter数据库分析COL6基因家族各成员表达水平与胃癌患者总生存期(OS)和无复发生存期(RFS)
之间的关系。通过cBioPortal数据库分析胃癌患者中COL6基因的遗传变异、共表达与邻近基因网络情况。通
过STRING数据库和仙桃学术绘制COL6家族蛋白互作网络图,并进行功能富集分析,分析其作用机制。结
果在胃腺癌中,COL6基因家族(COL6A1、COL1A2、COL6A3、COL6A4P1、COL6A4P2、COL6A5和COL6A6)的
表达相对于邻近的正常组织上调,且COL6A1(P=0.000367)、COL6A2(P=0.00017)、COL6A3(P园.001)、
COL6A4P1(P=0.864)、COL6A4P2(P=0.355)、COL6A5(P=0.187)和COL6A6(P=0.302)的表达与胃癌患者的
病理分期相关。高表达的COL6A1(P=0.047)、COL6A2(P=0.017)、COL6A3(P=0.02)、COL6A5(P=0.028)和
COL6A6(P=0.025)胃癌患者生存率均较低,而COL6A4P1(P=0.006)、COL6A4P2(P=0.0091)和COL6A6(P=
0.002)与患者的转移或复发相关。KEGG功能富集分析显示差异表达的COL6A1、COL6A2、COL6A3、
COL6A4P1、COL6A4P2、COL6A5、COL6A6的细胞功能与病灶黏附、细胞外基质受体相互作用信号通路有关。
结论COL6家族是胃癌预后的潜在生物标志物,且与胃癌的免疫浸润相关。
关键词:COL6家族;胃癌;生物标志物;预后
中图分类号:R735.2文献标识码:ADOI院10.16050/ki.issn1674-6309.202源.园圆.005
胃癌(gastriccancer,GC)是消化道最常见的白,主要存在于BM区域,也是几种肿瘤微环境
恶性肿瘤之一,也是癌症相关死亡的第四大原[4-5]
(tumormicroenvironment,TME)中的关键成分。
[1]
因。GC患者总生存期(overallsurvival,OS)短、胶原蛋白遇主要包括3个亚型:琢1(遇)、琢2(遇)
复发或转移早的主要原因是患者没有特异性的和琢3(遇),分别由COL6A1、COL6A2和COL6A3
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