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基于C堡遗传背景穞稻染色体片段置换系群体的水稻落粒性QTL定位研究

一、引言

1.1研究背景与目的

1.1.1研究背景

水稻作为全球重要的粮食作物之一，为超过半数的世界人口提供主食。其产量和品质直接关系到粮食安全和人类生活质量。在水稻的众多农艺性状中，落粒性是一个关键且复杂的性状，对水稻生产有着极为重要的影响。

野生稻具有易落粒的特性，这有助于其在自然环境中繁衍和扩散种子。然而，对于人工栽培的水稻而言，易落粒的品种在收获过程中会导致大量籽粒脱落，从而造成严重的产量损失。据相关研究表明，在收获季节，易落粒品种的产量损失可达10%-30%，这对于农业生产来说是一个巨大的挑战。相反，难落粒的品种虽然在收获时能减少籽粒损失，但可能会给收获过程带来不便，例如需要耗费更多的人力和物力进行收割和脱粒，增加了生产成本。因此，适度的落粒性对于水稻生产至关重要，它既能保证在收获时减少产量损失，又能便于高效地进行收获作业。

此外，水稻的落粒性还与其他农艺性状存在着复杂的关联。一些研究发现，落粒性与水稻的抗倒伏性、抗病性以及品质等性状之间可能存在着一定的遗传连锁关系。例如，某些易落粒的品种可能同时具有较强的抗倒伏能力，但品质可能相对较差；而一些难落粒的品种可能品质优良，但抗倒伏性较弱。深入研究这些关联，对于全面了解水稻的遗传特性和培育综合性状优良的品种具有重要意义。

穞稻作为一种特殊的稻种资源，具有独特的遗传背景和生物学特性。它是一种较原始的亚洲栽培稻粳稻类型，在长期的自然选择和进化过程中，积累了许多优异的基因资源。这些基因资源对于现代水稻育种具有重要的价值，可以为解决水稻生产中的各种问题提供新的途径和方法。例如，穞稻中可能含有一些与落粒性相关的基因，这些基因的表达调控机制可能与普通栽培稻不同，通过研究穞稻的落粒性遗传机制，可以为揭示水稻落粒性的分子调控网络提供新的线索。同时，穞稻还可能具有一些其他优良性状，如对病虫害的抗性、对逆境环境的耐受性等，将这些优良性状导入到普通栽培稻中，可以丰富水稻的遗传多样性，提高水稻的综合生产能力。

1.1.2研究目的

本研究旨在利用C堡遗传背景的穞稻染色体片段置换系群体，精准定位水稻落粒性相关的数量性状位点（QTL）。通过对该群体进行系统的表型鉴定和基因型分析，明确影响水稻落粒性的关键遗传区域，为深入解析水稻落粒性的遗传机制奠定基础。具体目标包括：一是构建稳定的C堡遗传背景的穞稻染色体片段置换系群体，并对其进行全面的遗传背景分析，确保群体的可靠性和有效性；二是对置换系群体的落粒性进行精确的表型鉴定，建立科学合理的落粒性评价指标体系；三是利用分子标记技术，结合表型数据，定位与水稻落粒性相关的QTL，并分析其遗传效应和作用方式；四是对定位到的关键QTL进行深入研究，挖掘与之紧密连锁的分子标记，为水稻落粒性的分子标记辅助选择育种提供技术支持，从而加快培育落粒性适度的水稻新品种。

1.2国内外研究现状

1.2.1水稻落粒性的遗传研究

水稻落粒性的遗传机制研究一直是水稻遗传学领域的重要课题。早期研究表明，控制水稻落粒性的基因主要包括主基因和数量性状基因座（QTL）。在主基因方面，通过对野生稻与栽培稻及栽培稻之间杂交后代的遗传研究，已成功定位了5个落粒性基因，分别为sh-1、sh-2、sh-3、sh-4和sh-h，它们被分别定位在水稻第11、1、4、3和7染色体上。其中，sh-2被认为是籼稻和粳稻亚种中主要的落粒性基因，而sh-3则来源于普通野生稻。例如，有研究利用籼粳杂交产生的加倍单倍体群体，将sh-2定位在第1染色体RFLP标记RGI72b与RG152b之间，并随后成功克隆了该基因；国外专家利用BC4F2群体和RFLP标记对sh-3进行定位，发现其位于第4染色体R1427和C107之间，与标记的遗传距离均为2.3cM，之后该基因也被克隆。

在QTL研究方面，众多学者利用不同的群体和方法对水稻落粒性进行了QTL分析。Fukuta等利用籼粳交后代F2分离群体，在第1、2、5、11和12染色体上检测到5个QTL，其中第1染色体上的QTL为主效基因，推测它可能位于sh-2附近；有研究利用Aijiaonante/P16的F2分离群体，共检测出5个落粒性QTL，分别位于水稻第1、3、4、6和8染色体上；我国专家利用珍汕97B/密阳46所构建的RIL群体，分别在第1、2、3、6、7和11染色体上检测到7个落粒性QTL，并分析了每个QTL的效应大小；许旭明等利用重组自交系群体，检测到与籼稻落粒性相关的7个QTL，分别位于第1、2、4、6和7