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生物信息分析师考试试卷
一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)
目前主流的Illumina测序技术核心原理是?
A.纳米孔电信号识别
B.边合成边测序(SequencingbySynthesis)
C.焦磷酸测序(Pyrosequencing)
D.连接法测序(SequencingbyLigation)
答案:B
解析:Illumina测序采用边合成边测序技术,通过dNTP末端荧光标记实现碱基识别;A为牛津纳米孔技术原理,C为454测序原理,D为SOLiD测序原理。
FASTQ文件中每行的典型结构是?
A.序列ID、序列、质量分数、质量标识
B.序列ID、质量标识、序列、质量分数
C.序列ID、序列、质量标识、质量分数
D.序列、序列ID、质量分数、质量标识
答案:C
解析:FASTQ文件以四行为一组,依次为:@序列ID(第一行)、核苷酸序列(第二行)、+质量标识(第三行)、质量分数(第四行);其他选项顺序错误。
Phred质量分数Q20对应的碱基错误概率是?
A.0.1%
B.1%
C.10%
D.20%
答案:B
解析:Phred分数公式为Q=-10log??(P),Q20时P=10^(-20/10)=0.01(1%);Q30对应0.1%(A错误),Q10对应10%(C错误)。
BAM文件的本质是?
A.压缩的FASTA文件
B.SAM文件的二进制压缩格式
C.原始测序数据的加密存储
D.蛋白质结构的三维坐标文件
答案:B
解析:BAM(BinaryAlignment/Map)是SAM(SequenceAlignment/Map)的二进制压缩格式,便于存储和快速读取;A为FASTA压缩格式,D为PDB文件功能。
GATK(GenomeAnalysisToolkit)的核心功能是?
A.序列比对
B.变异检测(SNP/Indel)
C.基因定量
D.蛋白质结构预测
答案:B
解析:GATK是Broad研究所开发的变异检测工具,主要用于基因组变异的识别与校正;A为BWA/Bowtie功能,C为Salmon/StringTie功能。
RNA-seq差异表达分析中,DESeq2算法假设数据服从?
A.正态分布
B.泊松分布
C.负二项分布
D.二项分布
答案:C
解析:RNA-seq计数数据存在过离散(Overdispersion),DESeq2通过负二项分布模型校正均值与方差的关系;泊松分布假设均值=方差(B错误),不适合实际数据。
KEGG数据库的主要功能是?
A.基因表达谱存储
B.蛋白质结构预测
C.代谢通路与疾病关联分析
D.单细胞测序数据整合
答案:C
解析:KEGG(KyotoEncyclopediaofGenesandGenomes)聚焦于生物通路(如代谢、信号转导)和疾病相关基因的注释;A为GEO/ENA功能,B为SWISS-MODEL功能。
BLAST算法主要用于?
A.全基因组比对
B.局部相似序列搜索
C.长读长纠错
D.基因结构预测
答案:B
解析:BLAST(BasicLocalAlignmentSearchTool)通过寻找局部高同源区域实现快速序列相似性搜索;全基因组比对常用MUMmer(A错误)。
单细胞测序中,10xGenomics平台的核心技术是?
A.微流控液滴分隔单个细胞
B.原位杂交标记转录本
C.纳米孔直接读取RNA序列
D.流式细胞术分选细胞
答案:A
解析:10xGenomics利用微流控技术将单个细胞与带条形码的磁珠包裹在液滴中,实现高通量单细胞分离;D为细胞分选技术,非测序核心。
生物信息分析中,伦理规范的核心关注点是?
A.计算资源的分配效率
B.原始数据的存储格式
C.样本提供者的隐私保护
D.分析软件的版权归属
答案:C
解析:生物信息分析涉及人类基因组数据时,需遵守HIPAA(健康保险携带和责任法案)等规范,重点保护样本个体的隐私(如去标识化);其他选项非伦理核心。
二、多项选择题(共10题,每题2分,共20分)
以下属于Illumina测序平台特点的是?()
A.读长通常50-300bp
B.单碱基错误率约0.1%
C.基于纳米孔电信号识别
D.支持边合成边测序
答案:ABD
解析:Illumina为短读长(A正确)、高准确性(B正确)、边合成边测序(D正确);纳米孔为牛津平台技术(C错误)。
FASTQ文件中质量分数的编码方式包括?()
A.Phred+33
B.Phred+64
C.ASCII+10
D.Unicode+20
答案:AB
解析:常见质量编码为Sanger标准(Phred+33,ASCII33-126)
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