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中药新药与临床药理2025年6月第36卷第6期·937·

基于网络药理学整合UHPLC-QExactive分析、转录组学及分子

对接探讨刺梨干预动脉粥样硬化的作用机制

1，23313111

邓滢滢，戴莹莹，吴杨旸，李昕，朱锦华，于红红，段学清，田维毅（1.贵州中医药大学基础

医学院，贵州贵阳550025；2.贵阳市第二人民医院中医科，贵州贵阳550023；3.贵州中医药大学药学院，

贵州贵阳550025）

摘要：目的基于超高效液相色谱-四极杆-静电场轨道阱组合质谱联用系统（UHPLC-QExactive）、网络药理

学、转录组学及分子对接技术探讨刺梨治疗动脉粥样硬化（AS）的潜在作用机制。方法将12只雄性ApoE-/-小

鼠随机分为模型组（6只）、刺梨原液组（6只，500mg·kg-1），给予高脂饲料喂养10周诱导AS小鼠模型；造模

成功后，按照相应剂量灌胃给药，每日1次，持续给药12周。采用UHPLC-QExactive技术分析刺梨原液的化

学成分；采用UHPLC-QExactiveHF-X技术分析模型组与刺梨原液组小鼠血清的化学成分，通过OPLS-DA模

型得到的变量权重值（VIP）及t检验的P值来确定显著差异代谢物；将筛选出的显著差异代谢物与刺梨原液的

化学成分逐一对比，筛选出刺梨入血成分。使用SwissTargetPrediction数据库预测刺梨原液入血成分的作用靶

点；通过GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库检索AS疾病相关靶点；对刺梨原液入血成分作用靶点与AS疾

病相关靶点取交集，筛选出刺梨原液治疗AS的潜在作用靶点。利用STRING数据库构建潜在作用靶点蛋白互

作（PPI）网络，筛选出核心靶点；通过Cytoscape3.10.0软件构建“成分-靶点-疾病”网络，筛选出核心成分；

通过DAVID数据库对潜在作用靶点进行GO功能及KEGG通路富集分析。对小鼠主动脉组织总RNA进行转录

组学测序，筛选差异表达基因（DEGs）；使用Venny2.1平台对DEGs与刺梨原液治疗AS的潜在作用靶点取交

集，对交集靶点进行PPI网络分析，得到刺梨干预AS的关键调控靶点。将关键调控靶点分别与刺梨干预AS

的核心成分进行分子对接验证。结果共鉴定出刺梨化学成分468种，模型组vs刺梨原液组血清差异代谢

物423种，筛选出刺梨原液入血成分65种。得到入血成分对应的主要作用靶点137个，AS疾病相关靶点

5000个，刺梨原液-AS交集靶点96个。对137个刺梨入血成分作用靶点与5000个AS疾病相关靶点取交

集，共获得刺梨治疗AS的潜在作用靶点96个。筛选出刺梨干预AS的核心靶点包括AKT1、STAT3、EGFR、

PTGS2、HSP90AA1、TLR4、MMP9、ESR1、ACE、MAPK1等；筛选出核心成分包括苯丙氨酸-脯氨酸二肽

（Phe-Pro）、酪氨酸-谷氨酸二肽（Tyr-Glu）、11-（2-羟基-3，4-二甲基-5-氧代呋喃-2-基）十一烷酸[11-（2-

hydroxy-3，4-dimethyl-5-oxofuran-2-yl）undecanoicacid]、γ-谷氨酰-酪氨酸二肽（gamma-Glu-Tyr）和2-丙基

戊二酸（2-Propylglutaricacid）等。潜在作用靶点主要涉及炎症反应调控、脂质代谢过程调节及细胞增殖调控等

生物过程，以及神经活性配体-受体相互作用、癌症、雌激素、化学致癌作用受体和钙离子等KEGG信号通

路。共鉴定出模型组vs刺梨原液组的DEGs共有1385个，与96个潜在作用靶点取交集，得到13个交集靶

点，通过PPI分析最终得到7个刺梨干预AS的关键调控靶点：MMP9、CASP1、CCR1、CCR5、PTPN1、

MMP13、ANPEP。分子对接显示，苯丙氨酸-脯氨酸二肽、11-（2-羟基-3，4-二甲基-5-氧代呋喃-2-基）十一

烷酸分别与MMP9、CASP1、CCR1、CCR5