蛋白质组学硕士.pptVIP

主要内容;;基因组学(Genomics)：1986年美国科学家ThomasRoderick提出了基因组学指对所有基因进行基因组作图(包括遗传图谱、物理图谱、转录本图谱)、核苷酸序列分析、基因定位和基因功能分析的一门科学。;人类基因组计划（HumanGenomeProject,HGP)？;HGP的最初目标通过国际合作，用15年时间(1990～2005)至少投入30亿美元，构建详细的人类基因组遗传图和物理图，确定人类DNA的全部核苷酸序列，定位约10万基因，并对其它生物进行类似研究。

4张图：

HGP的终极目标

阐明人类基因组全部DNA序列；

识别基因；

建立储存这些信息的数据库；

开发数据分析工具；

研究HGP实施所带来的伦理、法律和社会问题。;HGP的

历史回顾;第一个自由生物体流感嗜血菌(H.inf)的全基因组测序完成

1996完成人类基因组计划的遗传作图

启动模式生物基因组计划;1997大肠杆菌(E.coli)全基因组测序完成

1998完成人类基因组计划的物理作图

开始人类基因组的大规模测序

Celera公司加入，与公共领域竞争

启动水稻基因组计划

1999.7第5届国际公共领域人类基因组测序会议，加快测序速度;1999.7第5届国际公共领域人类基因组测序会议，加快测序速度

2000Celera公司宣布完成果蝇基因组测序

国际公共领域宣布完成第一个植物基因组——拟南芥全基

因组的测序工作

公共领域和Celera公司同时宣布完成人类基因组工作草图

《Nature》刊文发表国际公共领域结果

《Science》刊文发表Celera公司及其合作者结果;2001年2月15日《Nature》封面;2001年8月26日人类基因组“中国卷”的绘制工作宣告完成。

2002年水稻、小鼠、疟原虫等基因组测序完成

2003年4月14日中、美、日、德、法、英等6国科学家宣布人类基因组序列图绘制成功，人类基因组计划的所有目标全部实现。

2003年10月，2004年10月人类基因组完成图公布。

;人类基因组计划的实施意义;人类基因组研究的兴起标志着生命科学进入一个从总体、综合角度理解生命活动分子基础的新阶段。随着1990年人类基因组（HumanGenomeProject,HGP)的实施并取得巨大成就,研究重心从开始的揭示生命的???有遗传信息转移到在分子整体水平对功能的研究上。

;基因组学领域的分类;结构基因组学（Structuralgenomics）

基因、蛋白质和其它生物大分子的全基因组（genome-wide）结构研究，包括基因组图谱绘制、基因组测序、基因组组织、以及蛋白质结构描述。

关键问题1：基因组数据分析的算法和工具。全基因组测序和基因组注释仍然是结构基因组学的关键，基因组序列提供了基因组组织和结构的重要信息；

关键问题2：基因组结构的破坏和控制。通过关闭基因功能或改变表达模式来检测；

关键问题3：蛋白质结构测定和预测。实验方法（蛋白质表达和结晶、X射线晶体分析、NMR等）与计算方法（统计分析、建模、蛋白质结构预测）相结合。;功能基因组学（Functionalgenomics）

基于全基因组（genome-wide）在系统水平上对生物系统功能各方面的研究，包括基因功能、调节网络。

功能基因组学的特征是将大规模的实验方法与统计分析、数学建模和实验结果分析结合起来。

全面认识和理解基因功能特征必须在RNA、蛋白质和代谢物水平上进行功能分析。;转录组学（Transcriptomics）

转录组（transcriptome）：细胞中所能转录得到的全部mRNA的集合

转录组学：通过高通量方法研究转录物组的表达动力学（发生和变化规律）

基因在mRNA水平上的变化与蛋白相关，研究mRNA表达模式对阐明未知基因的功能、调节途径和蛋白质网络等具有重要的意义

转录组不是细胞的功能执行实体，转录组分析只能间接探讨基因的功能;代谢组学（Metabolomics）

代谢组（metabolome）：指某一生物或细胞在一特定生理时期内所有的低分子量代谢产物（如metabolicintermediates,hormonesandothersignalingmolecules,andsecondarymetabolites）。

代谢组学：大规模研究代谢组的动力学和相互作用。

代谢组分析提供了有关基因功能的重要信息。与转录组、蛋白质组相比，代谢物的数量远少于基因或蛋白的数量，因此代谢组