人类基因组学.pptVIP

由强伯勤、陈竺等倡导启动最初的经费来源国家自然科学基金委员会“863”高科技计划启动的研究项目中华民族基因组中若干位点基因结构的研究重大基因相关基因的定位、克隆、结构与功能研究中国的人类基因组计划于1994年启动陈竺1998年3月由陈竺院士挂帅成立上海中心，10月改名为中国南方基因中心。同时，决定成立由国家卫生部牵头的若干中国人类遗传资源保护中心。强伯勤1999年由强伯勤院士牵头在北京先后成立了中国医学科学院北京人类基因组中心和北方人类基因组中心。杨焕明1998年由杨焕明和余军教授组织了中国科学院遗传所人类基因组中心。1999年9月1日，杨焕明教授在第五次伦敦国际人类基因组战略讨论会上介绍情况，会议正式接受中国加入国际合作，划定了测序区域，正式承担１％的测序任务。HGP的研究目标identifyalltheapproximately20,000-25,000genesinhumanDNA,determinethesequencesofthe3billionchemicalbasepairsthatmakeuphumanDNA,storethisinformationindatabases,improvetoolsfordataanalysis,transferrelatedtechnologiestotheprivatesector,andaddresstheethical,legal,andsocialissues(ELSI)thatmayarisefromtheproject.HGP的主要目标是测定全部DNA序列，因目前的测序技术不能进行很长的DNA测序，因此计划的第一阶段要分解基因组这一巨大的研究对象，将其分为容易操作的小的区域，这个过程简称为染色体作图。根据使用的标记和手段的不同，HGP的基本任务可用4张图谱来概括；即遗传图谱，物理图谱，转录图谱和序列图谱。遗传图谱（连锁图谱）构建遗传图谱的基本原理是真核生物遗传过程中会发生减数分裂，此过程中两条同源染色体要进行交换重组，重组百分率可以反映出染色体上两点之间相对距离，称遗传距离，单位为厘摩尔根（cM）。距离越近，重组率越小。根据遗传距离,可以确定同一染色体上基因间的相互距离,绘制遗传图谱。1cM的遗传距离表示在100个配子中有1个重组子。在哺乳动物中，遗传图谱上1cM的距离大约相当于物理图谱上1,000,000bp。人类基因组的全长约3600cM。遗传图是将每条染色体上的基因或遗传标记的相对位置经连锁分析确定下来，构成图谱，因此，需借助相应的遗传标记。DNA技术的建立为人类提供了大量新的遗传标记。遗传标记有三代着丝粒两侧的部分，较长的部分为长臂（q），较短的部分为短臂（p）。长臂1区3带为何要用分子标记进行

基因组作图基因组测序的基本策略是将整个基因组分割成一些小的片段分别测序,然后将测序的片段进行组装,使其回归到原来的位置.为了确保分散的基因片段正确归位组装,必须寻找一批标记,它们在染色体上的位置是已知的、唯一的、确定的,并位于不同的测序片段之中.基因组路标(landmarker)标记1标记2标记3染色体上的基因和DNA顺序均可作为路标,路标具有物理属性,他们由特定的DNA顺序组成.路标位于染色体上的位置是固定的,唯一的,不会更改的,因而提供了作图的依据第一代DNA遗传标记是RFLP（限制性片段长度多态性）。DNA序列上的微小变化，甚至1个核苷酸的变化，也能引起限制性内切酶切点的丢失或产生，导致酶切片段长度的变化。第二代DNA遗传标记利用了存在于人类基因组中的大量重复序列：重复单位长度在15-65个核苷酸左右的小卫星DNA；重复单位长度在2-6个核苷酸之间的微卫星DNA，又称为简短串联重复（STR、STRP或SSLP）。卫星DNA分类特征卫星DNA串联重复的基本单位首尾相接，在基因组中呈不均匀分布，但主要集中于着丝粒、端粒等特定部位，高度或中等重复，分属三个大家族。α卫星DNA中等重复，基本单位长171bp。小卫星DNA中等重复，基本单位长15~65bp。微卫星DNA中等重复，基本单位长2~8bp第二代DNA遗传标记STRP的优点是“多态性”与“高频率”。由于(A)n，(CA)n，(CGG)n等短重复序列在进化上不受选择，在同一位点上可重复单位数量变化很大，配对时又容易产生“错配”，使这样的位点遍布于整个基因组。已有5264个STRP为主体的遗传标记“连锁图”，