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新颖的有限元分析基于显微图像统计的自然描述子
内斯利汉·拜拉莫˜格鲁§坎纳拉§˚阿克‡米卡·卡基宁∗·埃克伦
德∗斯·尼斯‡简妮·海基尔¨a§
§芬兰奥卢大学机器视觉
‡芬兰图尔库大学生物技术
∗芬兰奥卢大学生物化学与分子医学学院
抽象的用作通用检测方法，并作为不同细胞系和显微镜模式的
在本文中，我们提出了一种基于图像统计的新颖特征描述后续分割[1]的先验。我们使用我们的特征描述符在细
算法。Thepipelinefirstperformst胞共培养物的相差成像中检测细胞球体，并在电子
componentanalysisontrainingimagepatchesto显微镜图像中检测线粒体。我们的方法在严重遮挡和混
obtainbasisvectors(filters)foralower乱的情况下工作，因此适用于大多数生物医学图像。实
dimensionalrepresen‑tation.然后，对于给定的图像，验结果表明比强基线方法有显着改进。
计算每个像素处的一组滤波器响应。最后，将考虑响应的
符号和幅度以及滤波器数量的直方图表示应用于局部图像
块。我们建议将这个想法应用于基于学习框架的显微镜图像
像素识别系统。实验结果表明，所算法在不同显微镜2.方法
模式的生物医学图像中比最先进的描述符表现得更好。
在传统的计算机视觉问题中，局部图像描述符因其已被证
明的成功而占据主导地位。文献中已经提出了各种描述符
索引术语——局部图像描述符、像素标记、细胞检测、
[3]。最广泛使用的局部区域描述符是尺度不变特征变换
相差成像、电子显微镜、线粒体、、细胞共培养。
（SIFT）[2]，它已成为比较的基线方法。局部二进制模
式（LBP）[4]和局部相位量化（LPQ）[5]是主要用于面
1。简介部和纹理识别的值得注意的特征描述符。局部特征描述符
已被证明在（生物）医学图像分析研究中也非常成功，例
为了从显微镜数据中获得定量细胞分析，需要能够自动如活细胞[6],细胞/对象检测[7,8,9],有丝分
提取复杂细胞动力学测量值的计算方法。在文献中，已割[10],细胞分类[11],以及图像对齐和配准[12]。
经有大量关于显微图像自动分析的工作。然而，医学和
生物医学图像分析领域的大多数都描述了解决特定我们的方法受到SIFT和的二进制描述符（称
任务的算法或解决方案。图像数据中的显微镜类型、分为二值化统计图像特征（BSIF）[13]）的启发。我们的描
子标记、分辨率、图像质量、细胞外观和细胞动力学的述符计算与SIFT中的梯度方向分箱具有类似的步骤。在
多样性很高。因此，通常情况下，利用现有方法来解决SIFT中，每个像素都分配给方向箱，并按梯度幅值加权。
这些和需求并不适用。的是开发一种在自然而，与SIFT相比，我们对每个像素使用一组线性滤波
动显微图像分析中具有广泛应用领域的通用算法。器的响应。另一方面，BSI
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