一株新型海洋噬藻体QB2的分离、基因组学分析及生物地理分布.pdfVIP

第56卷第2期海洋与湖沼Vol.56,No.2

2025年3月OCEANOLOGIAETLIMNOLOGIASINICAMar.2025

一株新型海洋噬藻体QB2的分离、基因组学

分析及生物地理分布*

151111

苏畅崔丹华周洪艳王天聪王褚晓陈鑫

邵红兵1,2,3①郭萃1,2,3①汪岷1,2,3,4

（1.中国海洋大学海洋生命学院，海洋生物多样性与进化教育部重点实验室山东青岛266003；2.中国海洋大学海洋生物多

样性与进化研究所山东青岛266003；3.中国海洋大学深海圈层与地球系统前沿科学中心山东青岛266003；

4.中国海洋大学海德学院山东青岛266003；5.青岛市第八人民医院山东青岛266121）

摘要在南海海盆区分离得到一株侵染海洋聚球藻的噬藻体QB2，分析表明其基因组全长为

171898bp，GC含量为41.49%。在噬藻体QB2基因组中检测到212个开放阅读框（ORFs）和7个

tRNA基因。所预测到的ORFs根据功能可分为病毒粒子结构模块、DNA复制与调控模块、包装模块

和辅助代谢功能模块。其携带有与光合作用、碳代谢、磷代谢、能量获取和应激调节等相关的20个辅

助代谢基因，可能在调控噬藻体侵染过程中宿主的能量代谢方面发挥关键作用。系统发育分析表明噬藻

体QB2与Kyanoviridae科Tefnutvirus属成员亲缘关系密切，且与该属成员S-IOM18的核苷酸同一性

为80.3%，表明噬藻体QB2可被归类为Tefnutvirus属的新物种。噬藻体QB2的同源基因的生物地理分

布分析表明，其主要分布在温热带海洋浅层区、温热带海洋中层区以及北极海区。本研究丰富了蓝藻噬

藻体的基因组数据库，为进一步研究噬藻体的系统发育及其与宿主的相互作用提供了基础数据。

关键词噬藻体;聚球藻;基因组分析;辅助代谢基因;生物地理分布

中图分类号Q939.48doi:10.11693/hyhz20241100249

海洋蓝细菌(也被称作蓝藻)是海洋微型浮游光合(Denisetal,2000)。

自养生物的主要类群，主要包括聚球藻属病毒是海洋中最丰富的非细胞生物实体

(Synechococcus)和原绿球藻属(Prochlorococcus)，二者(Wommacketal,2000)，其在海洋中的总数约为1030，

广泛分布于全球大面积海域，贡献了约25%的全球初在海洋生态系统中扮演重要角色(Suttle,2007)。首

级生产力，在维持营养物质循环，调节气候变化等方面先，病毒可以通过裂解宿主细胞调控生物的群落结构。

发挥着重要作用(Flombaumetal,2013;Schadetal,在海洋环境中，病毒具有广泛的宿主范围，从微小的浮

2019)。其中，聚球藻的全球总数量约为(7.0±0.3)×1026游生物(如细菌)到大型的生物体(如无脊椎动物、各类

个细胞(Flombaumetal,2013)。不同类群的聚球藻所鱼类)(Munn,2006)。生态系统中宿主丰度的增加往

适应的生长环境往往相差巨大。除了已知的一些水文往伴随着相应病毒数量的上升，这种动态平衡关系使

环境如温度、